RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 FMN1Q68DA7 1419 aa24.72■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 KIF14Q15058 1648 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.55
CITED1-204ENST00000427412 FBXO41Q8TF61 875 aa24.66■■□□□ 1.54
CITED1-204ENST00000427412 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.66■■□□□ 1.54
CITED1-204ENST00000427412 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.65■■□□□ 1.54
CITED1-204ENST00000427412 KDM5CP41229 1560 aa24.64■■□□□ 1.54
CITED1-204ENST00000427412 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.61■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.61■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.6■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 ATP10AO60312 1499 aa24.59■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.59■■□□□ 1.53
CITED1-204ENST00000427412 REREQ9P2R6 1566 aa24.57■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 PREX2Q70Z35 1606 aa24.57■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.56■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.54■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 CLIP1P30622 1438 aa24.53■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.53■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 ABCA6Q8N139 1617 aa24.52■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.52■■□□□ 1.52
CITED1-204ENST00000427412 ABCC1P33527 1531 aa24.5■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.49■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 HSPA2P54652 639 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.48■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 MLECQ14165 292 aa24.46■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
CITED1-204ENST00000427412 STRCQ7RTU9 1775 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.44■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 C3P01024 1663 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.43■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 AGLP35573 1532 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.42■■□□□ 1.5
CITED1-204ENST00000427412 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.38■■□□□ 1.49
CITED1-204ENST00000427412 AFAP1Q8N556 730 aa24.38■■□□□ 1.49
CITED1-204ENST00000427412 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
CITED1-204ENST00000427412 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.34■■□□□ 1.49
CITED1-204ENST00000427412 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
CITED1-204ENST00000427412 MROH2AA6NES4 1674 aa24.32■■□□□ 1.48
CITED1-204ENST00000427412 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CITED1-204ENST00000427412 CERKQ8TCT0 537 aa24.29■■□□□ 1.48
CITED1-204ENST00000427412 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.27■■□□□ 1.48
CITED1-204ENST00000427412 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 PLXNC1O60486 1568 aa24.24■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.23■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 ATP7AQ04656 1500 aa24.2■■□□□ 1.47
CITED1-204ENST00000427412 PTPRTO14522 1441 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.2■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 NPATQ14207 1427 aa24.17■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.16■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.16■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 NCOA1Q15788 1441 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.14■■□□□ 1.46
CITED1-204ENST00000427412 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.13■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 TIAM1Q13009 1591 aa24.12■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.1■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 A2MP01023 1474 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.09■■□□□ 1.45
CITED1-204ENST00000427412 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 ZMYM3Q14202 1370 aa24.04■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.03■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 PLA2R1Q13018 1463 aa24.02■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CITED1-204ENST00000427412 MBD5Q9P267 1494 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 PTPRKQ15262 1439 aa24■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 CEP162Q5TB80 1403 aa23.98■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.96■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.95■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.95■■□□□ 1.43
CITED1-204ENST00000427412 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CITED1-204ENST00000427412 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CITED1-204ENST00000427412 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.91■■□□□ 1.42
CITED1-204ENST00000427412 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.89■■□□□ 1.42
CITED1-204ENST00000427412 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.89■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.88■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.88■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.88■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.87■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 GGT6Q6P531 493 aa23.87■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 PKD2Q13563 968 aa23.86■■□□□ 1.41
CITED1-204ENST00000427412 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms