RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRJ-201ENST00000418331 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-201ENST00000418331 STK26Q9P289 416 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCA4P51532 1647 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX12O15370 315 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.018e-7■■■■□ 23
PTPRJ-201ENST00000418331 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.55■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 JPH4Q96JJ6 628 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF3BO15066 747 aa27.54■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 RALBP1Q15311 655 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.53■■■□□ 2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PTPRJ-201ENST00000418331 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PTPRJ-201ENST00000418331 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRJ-201ENST00000418331 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRJ-201ENST00000418331 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRJ-201ENST00000418331 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.35■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa27.35■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNJ4P48050 445 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NLRP13Q86W25 1043 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FGD1P98174 961 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NPHP1O15259 732 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HSCBQ8IWL3 235 aa27.26■■□□□ 1.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRGP23470 1445 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 IGF1RP08069 1367 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA2Q08379 1002 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.2■■□□□ 1.95
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP44Q96MT7 982 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 APBB1O00213 710 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 MCCP23508 829 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE3BQ13370 1112 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF15Q9NS87 1388 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 EID1Q9Y6B2 187 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRJ-201ENST00000418331 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCB2Q00722 1185 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PANK3Q9H999 370 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-201ENST00000418331 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 STK31Q9BXU1 1019 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 UACAQ9BZF9 1416 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 USP47Q96K76 1375 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 NCAPD3P42695 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 NUTM2FA1L443 756 aa27■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 LMOD3Q0VAK6 560 aa27■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 AMPHP49418 695 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRJ-201ENST00000418331 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF21BO75037 1637 aa26.94■■□□□ 1.9
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