RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418161.1

CCDC13-AS1-201, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 2,049 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PREX2Q70Z35 1606 aa15.03■□□□□ -0
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.03■□□□□ -0
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.02□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FANCAO15360 1455 aa15.02□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.02□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AKNAQ7Z591 1439 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MIA2Q96PC5 1412 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NEO1Q92859 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADGRL1O94910 1474 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCC1P33527 1531 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAPGEF3O95398 923 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HRCP23327 699 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ITGAEP38570 1179 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AFAP1Q8N556 730 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KDM6BO15054 1643 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MBD5Q9P267 1494 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.83□□□□□ -0.03
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RICTORQ6R327 1708 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCC5O15440 1437 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DAPK1P53355 1430 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TSPY4P0CV99 314 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TSPY10P0CW01 314 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KDM5CP41229 1560 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PTPRKQ15262 1439 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ATP7AQ04656 1500 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCA6Q8N139 1617 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.71□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NCOA1Q15788 1441 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF15Q9NS87 1388 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADGRL2O95490 1459 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PLXNC1O60486 1568 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ROCK1Q13464 1354 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ATP10AO60312 1499 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 A2MP01023 1474 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HFM1A2PYH4 1435 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NAIPQ13075 1403 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF3BO15066 747 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MLECQ14165 292 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ERBINQ96RT1 1412 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 REREQ9P2R6 1566 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GGT6Q6P531 493 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms