RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416995.1

LINC02558-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2558, humanhuman

TSL 5

Gene LINC02558, Length 178 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02558-201ENST00000416995 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.06■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 KIF14Q15058 1648 aa25.06■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.05■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.03■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.03■■□□□ 1.6
LINC02558-201ENST00000416995 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
LINC02558-201ENST00000416995 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.98■■□□□ 1.59
LINC02558-201ENST00000416995 CLIP1P30622 1438 aa24.97■■□□□ 1.59
LINC02558-201ENST00000416995 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.95■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 MLECQ14165 292 aa24.94■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 ATP10AO60312 1499 aa24.94■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.94■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.92■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.91■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.91■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 AFAP1Q8N556 730 aa24.9■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.9■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.89■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 KDM5CP41229 1560 aa24.89■■□□□ 1.58
LINC02558-201ENST00000416995 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.89■■□□□ 1.57
LINC02558-201ENST00000416995 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.87■■□□□ 1.57
LINC02558-201ENST00000416995 HSPA2P54652 639 aa24.85■■□□□ 1.57
LINC02558-201ENST00000416995 PREX2Q70Z35 1606 aa24.85■■□□□ 1.57
LINC02558-201ENST00000416995 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.83■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 ABCC1P33527 1531 aa24.81■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.8■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.8■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.79■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 FBXO41Q8TF61 875 aa24.79■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.79■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.78■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 ABCA6Q8N139 1617 aa24.77■■□□□ 1.56
LINC02558-201ENST00000416995 REREQ9P2R6 1566 aa24.76■■□□□ 1.55
LINC02558-201ENST00000416995 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.76■■□□□ 1.55
LINC02558-201ENST00000416995 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LINC02558-201ENST00000416995 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.7■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.69■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 AGLP35573 1532 aa24.69■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.67■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
LINC02558-201ENST00000416995 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.64■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 C3P01024 1663 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.61■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.59■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.58■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.58■■□□□ 1.53
LINC02558-201ENST00000416995 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 STRCQ7RTU9 1775 aa24.56■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 CERKQ8TCT0 537 aa24.54■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 ATP7AQ04656 1500 aa24.53■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 CEP162Q5TB80 1403 aa24.52■■□□□ 1.52
LINC02558-201ENST00000416995 TIAM1Q13009 1591 aa24.51■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.5■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 PLXNC1O60486 1568 aa24.49■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.48■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 A2MP01023 1474 aa24.47■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 MROH2AA6NES4 1674 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC02558-201ENST00000416995 ZMYM3Q14202 1370 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 MBD5Q9P267 1494 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 NPATQ14207 1427 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 PTPRTO14522 1441 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 NCOA1Q15788 1441 aa24.39■■□□□ 1.5
LINC02558-201ENST00000416995 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.39■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 GGT6Q6P531 493 aa24.38■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 NCOA2Q15596 1464 aa24.36■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.35■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.34■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 PTPRKQ15262 1439 aa24.34■■□□□ 1.49
LINC02558-201ENST00000416995 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.32■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.32■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.3■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.3■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.29■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.28■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.27■■□□□ 1.48
LINC02558-201ENST00000416995 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.26■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.25■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 KIF3BO15066 747 aa24.24■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.22■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 PLA2R1Q13018 1463 aa24.22■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
LINC02558-201ENST00000416995 PKD2Q13563 968 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC02558-201ENST00000416995 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms