RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K1Q13233 1512 aa27.36■■□□□ 1.97
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PREX2Q70Z35 1606 aa27.35■■□□□ 1.97
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAPGEF3O95398 923 aa27.35■■□□□ 1.97
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.34■■□□□ 1.97
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APLP2Q06481 763 aa27.33■■□□□ 1.97
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.32■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.32■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.32■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.3■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.29■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.27■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.27■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA2Q15596 1464 aa27.26■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RICTORQ6R327 1708 aa27.24■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC1P33527 1531 aa27.22■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.21■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.2■■□□□ 1.95
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.2■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.17■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.17■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.17■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.15■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.15■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AFAP1Q8N556 730 aa27.14■■□□□ 1.94
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.13■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.13■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.13■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.12■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM5CP41229 1560 aa27.12■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.09■■□□□ 1.93
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.07■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.06■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.05■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPRMP28827 1452 aa27.04■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.04■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.02■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIA2Q96PC5 1412 aa27.02■■□□□ 1.92
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP10AO60312 1499 aa27■■□□□ 1.91
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MBD5Q9P267 1494 aa27■■□□□ 1.91
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.99■■□□□ 1.91
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.95■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MADDQ8WXG6 1647 aa26.94■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.94■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.94■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCA6Q8N139 1617 aa26.93■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP7AQ04656 1500 aa26.92■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.91■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.9■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.9■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REREQ9P2R6 1566 aa26.88■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.86■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.86■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.85■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPY4P0CV99 314 aa26.85■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPY10P0CW01 314 aa26.85■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.83■■□□□ 1.89
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGLP35573 1532 aa26.81■■□□□ 1.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLECQ14165 292 aa26.81■■□□□ 1.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A2MP01023 1474 aa26.8■■□□□ 1.88
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLXNC1O60486 1568 aa26.75■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.75■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.74■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO41Q8TF61 875 aa26.73■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.73■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC5O15440 1437 aa26.73■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DAPK1P53355 1430 aa26.72■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.66■■□□□ 1.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.66■■□□□ 1.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF15Q9NS87 1388 aa26.6■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GGT6Q6P531 493 aa26.6■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.59■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.59■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF3BO15066 747 aa26.59■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPA2P54652 639 aa26.59■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.58■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.58■■□□□ 1.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.57■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.56■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.55■■□□□ 1.84
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms