RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413642.7

VEGFA-207, Transcript of vascular endothelial growth factor A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,197 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFA-207ENST00000413642 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.14■■■■■ 4.34
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VEGFA-207ENST00000413642 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.07■■■■■ 4.33
VEGFA-207ENST00000413642 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
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VEGFA-207ENST00000413642 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.03■■■■■ 4.32
VEGFA-207ENST00000413642 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.03■■■■■ 4.32
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VEGFA-207ENST00000413642 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.77■■■■■ 4.28
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VEGFA-207ENST00000413642 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
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VEGFA-207ENST00000413642 A2MP01023 1474 aa41.32■■■■■ 4.2
VEGFA-207ENST00000413642 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.29■■■■■ 4.2
VEGFA-207ENST00000413642 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.28■■■■■ 4.2
VEGFA-207ENST00000413642 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.27■■■■■ 4.2
VEGFA-207ENST00000413642 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.27■■■■■ 4.2
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VEGFA-207ENST00000413642 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.95■■■■■ 4.15
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VEGFA-207ENST00000413642 DAPK1P53355 1430 aa40.84■■■■■ 4.13
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VEGFA-207ENST00000413642 PTPRKQ15262 1439 aa40.83■■■■■ 4.13
VEGFA-207ENST00000413642 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
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VEGFA-207ENST00000413642 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
VEGFA-207ENST00000413642 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.79■■■■■ 4.12
VEGFA-207ENST00000413642 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.79■■■■■ 4.12
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