RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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ANKRD28-202ENST00000412318 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL11AQ9H165 835 aa5.97□□□□□ -1.45
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ANKRD28-202ENST00000412318 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.95□□□□□ -1.46
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ANKRD28-202ENST00000412318 GRIN2AQ12879 1464 aa5.93□□□□□ -1.46
ANKRD28-202ENST00000412318 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.93□□□□□ -1.46
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ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.93□□□□□ -1.46
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ANKRD28-202ENST00000412318 TSPOAP1O95153 1857 aa5.91□□□□□ -1.46
ANKRD28-202ENST00000412318 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.91□□□□□ -1.46
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ANKRD28-202ENST00000412318 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.9□□□□□ -1.46
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ANKRD28-202ENST00000412318 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 TMC1Q8TDI8 760 aa5.89□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.89□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.477e-7■■■■□ 22.6
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ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.89□□□□□ -1.47
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ANKRD28-202ENST00000412318 CDCA8Q53HL2 280 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.87□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.86□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.86□□□□□ -1.47
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ANKRD28-202ENST00000412318 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.84□□□□□ -1.47
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP155O75694 1391 aa5.84□□□□□ -1.48
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ANKRD28-202ENST00000412318 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF21BO75037 1637 aa5.83□□□□□ -1.48
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ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRTO14522 1441 aa5.82□□□□□ -1.48
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ANKRD28-202ENST00000412318 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.82□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 STK26Q9P289 416 aa5.82□□□□□ -1.48
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ANKRD28-202ENST00000412318 PTMSP20962 102 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 HOMEZQ8IX15 550 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP53Q96M91 514 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 KNSTRNQ9Y448 316 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 PREX1Q8TCU6 1659 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 ASXL2Q76L83 1435 aa5.79□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 MIER1Q8N108 512 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 NBR1Q14596 966 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 CUX1P39880 1505 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 MADDQ8WXG6 1647 aa5.78□□□□□ -1.48
ANKRD28-202ENST00000412318 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 TMF1P82094 1093 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
ANKRD28-202ENST00000412318 AFAP1Q8N556 730 aa5.77□□□□□ -1.49
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ANKRD28-202ENST00000412318 NUDCQ9Y266 331 aa5.77□□□□□ -1.49
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