RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.52■□□□□ 0.88
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LIMS1-204ENST00000409441 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.45■□□□□ 0.86
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LIMS1-204ENST00000409441 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.44■□□□□ 0.86
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LIMS1-204ENST00000409441 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.43■□□□□ 0.86
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LIMS1-204ENST00000409441 MBD5Q9P267 1494 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-204ENST00000409441 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
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LIMS1-204ENST00000409441 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-204ENST00000409441 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-204ENST00000409441 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.27■□□□□ 0.84
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LIMS1-204ENST00000409441 TSPY10P0CW01 314 aa20.25■□□□□ 0.83
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LIMS1-204ENST00000409441 ABCC5O15440 1437 aa20.23■□□□□ 0.83
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LIMS1-204ENST00000409441 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-204ENST00000409441 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-204ENST00000409441 KDM5CP41229 1560 aa20.13■□□□□ 0.81
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LIMS1-204ENST00000409441 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.1■□□□□ 0.81
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LIMS1-204ENST00000409441 ATP7AQ04656 1500 aa20.07■□□□□ 0.8
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LIMS1-204ENST00000409441 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-204ENST00000409441 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.06■□□□□ 0.8
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LIMS1-204ENST00000409441 ADGRL2O95490 1459 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-204ENST00000409441 KIF15Q9NS87 1388 aa20.03■□□□□ 0.8
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LIMS1-204ENST00000409441 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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LIMS1-204ENST00000409441 A2MP01023 1474 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-204ENST00000409441 PLXNC1O60486 1568 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-204ENST00000409441 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.97■□□□□ 0.79
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LIMS1-204ENST00000409441 NAIPQ13075 1403 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-204ENST00000409441 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.96■□□□□ 0.79
LIMS1-204ENST00000409441 HFM1A2PYH4 1435 aa19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-204ENST00000409441 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
LIMS1-204ENST00000409441 KIF3BO15066 747 aa19.94■□□□□ 0.78
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LIMS1-204ENST00000409441 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.92■□□□□ 0.78
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