RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405636.6

TOMM40-202, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-202ENST00000405636 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.85■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 PLCH2O75038 1416 aa39.84■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 GLI2P10070 1586 aa39.84■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.82■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.82■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 CD109Q6YHK3 1445 aa39.8■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.8■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.78■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.75■■■■□ 3.95
TOMM40-202ENST00000405636 ITGAEP38570 1179 aa39.72■■■■□ 3.95
TOMM40-202ENST00000405636 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.72■■■■□ 3.95
TOMM40-202ENST00000405636 TSPOAP1O95153 1857 aa39.7■■■■□ 3.95
TOMM40-202ENST00000405636 FANCAO15360 1455 aa39.68■■■■□ 3.94
TOMM40-202ENST00000405636 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.67■■■■□ 3.94
TOMM40-202ENST00000405636 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
TOMM40-202ENST00000405636 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
TOMM40-202ENST00000405636 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.61■■■■□ 3.93
TOMM40-202ENST00000405636 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.58■■■■□ 3.937e-7■■■□□ 18.5
TOMM40-202ENST00000405636 ABCC1P33527 1531 aa39.57■■■■□ 3.93
TOMM40-202ENST00000405636 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.57■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 PTPRKQ15262 1439 aa39.55■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.53■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 AKNAQ7Z591 1439 aa39.53■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 MBD5Q9P267 1494 aa39.52■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 DAPK1P53355 1430 aa39.52■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 ABCC5O15440 1437 aa39.51■■■■□ 3.92
TOMM40-202ENST00000405636 ADGRL1O94910 1474 aa39.5■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.5■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.47■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.47■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.46■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 NEO1Q92859 1461 aa39.46■■■■□ 3.91
TOMM40-202ENST00000405636 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.44■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.44■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.43■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.41■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.41■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 AFAP1Q8N556 730 aa39.34■■■■□ 3.89
TOMM40-202ENST00000405636 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.32■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.3■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 TSPY4P0CV99 314 aa39.27■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 TSPY10P0CW01 314 aa39.27■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.26■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 RAPGEF3O95398 923 aa39.26■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 RICTORQ6R327 1708 aa39.23■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.23■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.22■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.2■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 ADGRL2O95490 1459 aa39.2■■■■□ 3.87
TOMM40-202ENST00000405636 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 ROCK1Q13464 1354 aa39.18■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 KDM5CP41229 1560 aa39.17■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.17■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 NCOA1Q15788 1441 aa39.17■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 HFM1A2PYH4 1435 aa39.15■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 NAIPQ13075 1403 aa39.15■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.14■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.14■■■■□ 3.86
TOMM40-202ENST00000405636 ATP7AQ04656 1500 aa39.13■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.11■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.11■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.1■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.09■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 KDM6BO15054 1643 aa39.09■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 PLXNC1O60486 1568 aa39.08■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 KIF15Q9NS87 1388 aa39.07■■■■□ 3.85
TOMM40-202ENST00000405636 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.07■■■■□ 3.84
TOMM40-202ENST00000405636 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.06■■■■□ 3.84
TOMM40-202ENST00000405636 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.02■■■■□ 3.84
TOMM40-202ENST00000405636 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.01■■■■□ 3.83
TOMM40-202ENST00000405636 ABCA6Q8N139 1617 aa38.98■■■■□ 3.83
TOMM40-202ENST00000405636 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.96■■■■□ 3.83
TOMM40-202ENST00000405636 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.93■■■■□ 3.82
TOMM40-202ENST00000405636 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.92■■■■□ 3.82
TOMM40-202ENST00000405636 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.91■■■■□ 3.82
TOMM40-202ENST00000405636 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.83■■■■□ 3.81
TOMM40-202ENST00000405636 A2MP01023 1474 aa38.82■■■■□ 3.8
TOMM40-202ENST00000405636 ERBINQ96RT1 1412 aa38.8■■■■□ 3.8
TOMM40-202ENST00000405636 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
TOMM40-202ENST00000405636 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.78■■■■□ 3.8
TOMM40-202ENST00000405636 HRCP23327 699 aa38.75■■■■□ 3.79
TOMM40-202ENST00000405636 TRIM52Q96A61 297 aa38.73■■■■□ 3.79
TOMM40-202ENST00000405636 ATP10AO60312 1499 aa38.72■■■■□ 3.79
TOMM40-202ENST00000405636 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.68■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 KIF3BO15066 747 aa38.67■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 UNC13BO14795 1591 aa38.66■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 DEPDC5O75140 1603 aa38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms