RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-204	ENST00000400919	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
FAAP20-204	ENST00000400919	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FAAP20-204	ENST00000400919	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.86	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.83	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.82	■■■■■ 4.45
FAAP20-204	ENST00000400919	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAAP20-204	ENST00000400919	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FAAP20-204	ENST00000400919	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.66	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	ABCC1	P33527	1531 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.63	■■■■■ 4.42
FAAP20-204	ENST00000400919	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.63	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.61	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.58	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.58	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.57	■■■■■ 4.41
FAAP20-204	ENST00000400919	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.56	■■■■■ 4.4
FAAP20-204	ENST00000400919	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.54	■■■■■ 4.4
FAAP20-204	ENST00000400919	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FAAP20-204	ENST00000400919	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FAAP20-204	ENST00000400919	KDM5C	P41229	1560 aa		42.49	■■■■■ 4.39
FAAP20-204	ENST00000400919	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.46	■■■■■ 4.39
FAAP20-204	ENST00000400919	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.46	■■■■■ 4.39
FAAP20-204	ENST00000400919	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.46	■■■■■ 4.39
FAAP20-204	ENST00000400919	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAAP20-204	ENST00000400919	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAAP20-204	ENST00000400919	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FAAP20-204	ENST00000400919	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
FAAP20-204	ENST00000400919	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.41	■■■■■ 4.38
FAAP20-204	ENST00000400919	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.38	■■■■■ 4.37
FAAP20-204	ENST00000400919	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
FAAP20-204	ENST00000400919	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
FAAP20-204	ENST00000400919	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.34	■■■■■ 4.37
FAAP20-204	ENST00000400919	ATP10A	O60312	1499 aa		42.33	■■■■■ 4.37
FAAP20-204	ENST00000400919	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FAAP20-204	ENST00000400919	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FAAP20-204	ENST00000400919	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.29	■■■■■ 4.36
FAAP20-204	ENST00000400919	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.27	■■■■■ 4.36
FAAP20-204	ENST00000400919	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.23	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.22	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.21	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.21	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
FAAP20-204	ENST00000400919	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FAAP20-204	ENST00000400919	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FAAP20-204	ENST00000400919	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
FAAP20-204	ENST00000400919	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.15	■■■■■ 4.34
FAAP20-204	ENST00000400919	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FAAP20-204	ENST00000400919	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.1	■■■■■ 4.33
FAAP20-204	ENST00000400919	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
FAAP20-204	ENST00000400919	ABCC5	O15440	1437 aa		42.05	■■■■■ 4.32
FAAP20-204	ENST00000400919	MLEC	Q14165	292 aa		42.04	■■■■■ 4.32
FAAP20-204	ENST00000400919	A2M	P01023	1474 aa		42.04	■■■■■ 4.32
FAAP20-204	ENST00000400919	DAPK1	P53355	1430 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAAP20-204	ENST00000400919	AGL	P35573	1532 aa		42	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.99	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.99	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.98	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.97	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
FAAP20-204	ENST00000400919	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.94	■■■■■ 4.3
FAAP20-204	ENST00000400919	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3	1e-7	■■■■□ 21
FAAP20-204	ENST00000400919	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.91	■■■■■ 4.3
FAAP20-204	ENST00000400919	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.9	■■■■■ 4.3
FAAP20-204	ENST00000400919	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.89	■■■■■ 4.3
FAAP20-204	ENST00000400919	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.86	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.86	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.84	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.82	■■■■■ 4.29
FAAP20-204	ENST00000400919	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.81	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	KIF3B	O15066	747 aa		41.8	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	GGT6	Q6P531	493 aa		41.79	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	ITGAE	P38570	1179 aa		41.77	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	PTPRM	P28827	1452 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FAAP20-204	ENST00000400919	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.73	■■■■■ 4.27
FAAP20-204	ENST00000400919	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.69	■■■■■ 4.26
FAAP20-204	ENST00000400919	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.68	■■■■■ 4.26
FAAP20-204	ENST00000400919	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.68	■■■■■ 4.26
FAAP20-204	ENST00000400919	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
FAAP20-204	ENST00000400919	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.67	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms