RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399494.5

HMGB1-205, Transcript of high mobility group box 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HMGB1, Length 1,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1-205ENST00000399494 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.86■■■■■ 5.09
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HMGB1-205ENST00000399494 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
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HMGB1-205ENST00000399494 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
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HMGB1-205ENST00000399494 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.23■■■■■ 4.83
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