RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0556O60303 1618 aa18.31■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 KDM6BO15054 1643 aa18.3■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 JPH4Q96JJ6 628 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-201ENST00000398741 DAPK1P53355 1430 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 ROCK1Q13464 1354 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.24■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 FOXD1Q16676 465 aa18.23■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 ABCC5O15440 1437 aa18.21■□□□□ 0.51
PRAME-201ENST00000398741 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 SHROOM2Q13796 1616 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.2■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PRAME-201ENST00000398741 NCOA1Q15788 1441 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 CCDC7Q96M83 1385 aa18.14■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-201ENST00000398741 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 PZPP20742 1482 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ABCA8O94911 1581 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 MRS2Q9HD23 443 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 CCDC184Q52MB2 194 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 PTPRGP23470 1445 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ADGRL2O95490 1459 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-201ENST00000398741 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.02■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 OSCARQ8IYS5 282 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 KIF14Q15058 1648 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 ANP32EQ9BTT0 268 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 PKD2Q13563 968 aa17.98■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.96■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.96■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 MBD5Q9P267 1494 aa17.96■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.96■□□□□ 0.47
PRAME-201ENST00000398741 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 USP47Q96K76 1375 aa17.94■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 ATP10BO94823 1461 aa17.93■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.92■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 NUP155O75694 1391 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 TSPY4P0CV99 314 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 TSPY10P0CW01 314 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-201ENST00000398741 ABCC2Q92887 1545 aa17.89■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.88■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 KDM5CP41229 1560 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-201ENST00000398741 KIF15Q9NS87 1388 aa17.83■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.83■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.82■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.443e-11■□□□□ 9.5
PRAME-201ENST00000398741 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.79■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.79■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.77■□□□□ 0.44
PRAME-201ENST00000398741 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-201ENST00000398741 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms