RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.96■■□□□ 1.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRL1O94910 1474 aa23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCOA2Q15596 1464 aa23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAPGEF3O95398 923 aa23.89■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.89■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PREX2Q70Z35 1606 aa23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.83■■□□□ 1.41
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.83■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC1P33527 1531 aa23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIA2Q96PC5 1412 aa23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AFAP1Q8N556 730 aa23.75■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM5CP41229 1560 aa23.7■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RICTORQ6R327 1708 aa23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.69■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBD5Q9P267 1494 aa23.68■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.66■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.65■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.64■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.62■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP10AO60312 1499 aa23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.61■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.59■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPY4P0CV99 314 aa23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPY10P0CW01 314 aa23.58■■□□□ 1.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.56■■□□□ 1.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADRA2BP18089 450 aa23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP7AQ04656 1500 aa23.52■■□□□ 1.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REREQ9P2R6 1566 aa23.51■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.5■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC5O15440 1437 aa23.47■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGLP35573 1532 aa23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.46■■□□□ 1.35
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA6Q8N139 1617 aa23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAPK1P53355 1430 aa23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.45■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A2MP01023 1474 aa23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXD1Q16676 465 aa23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLXNC1O60486 1568 aa23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLECQ14165 292 aa23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF15Q9NS87 1388 aa23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCOA1Q15788 1441 aa23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRL2O95490 1459 aa23.31■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.3■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROCK1Q13464 1354 aa23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.29■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF3BO15066 747 aa23.28■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERBINQ96RT1 1412 aa23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.27■■□□□ 1.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRMP28827 1452 aa23.26■■□□□ 1.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGT6Q6P531 493 aa23.26■■□□□ 1.31
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