RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.54■□□□□ 0.24
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CTXN3-202ENST00000395322 MIA2Q96PC5 1412 aa16.5■□□□□ 0.23
CTXN3-202ENST00000395322 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.5■□□□□ 0.23
CTXN3-202ENST00000395322 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.5■□□□□ 0.23
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CTXN3-202ENST00000395322 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.5■□□□□ 0.23
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CTXN3-202ENST00000395322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.49■□□□□ 0.23
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CTXN3-202ENST00000395322 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.45■□□□□ 0.22
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CTXN3-202ENST00000395322 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CTXN3-202ENST00000395322 KIF14Q15058 1648 aa16.41■□□□□ 0.22
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CTXN3-202ENST00000395322 ARID3CA6NKF2 412 aa16.4■□□□□ 0.22
CTXN3-202ENST00000395322 AKNAQ7Z591 1439 aa16.4■□□□□ 0.22
CTXN3-202ENST00000395322 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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CTXN3-202ENST00000395322 MAPKBP1O60336 1514 aa16.33■□□□□ 0.2
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CTXN3-202ENST00000395322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.3■□□□□ 0.2
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CTXN3-202ENST00000395322 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.28■□□□□ 0.2
CTXN3-202ENST00000395322 ROCK1Q13464 1354 aa16.28■□□□□ 0.2
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CTXN3-202ENST00000395322 PREX2Q70Z35 1606 aa16.26■□□□□ 0.19
CTXN3-202ENST00000395322 ABCC5O15440 1437 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTXN3-202ENST00000395322 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.2■□□□□ 0.18
CTXN3-202ENST00000395322 ADGRL2O95490 1459 aa16.2■□□□□ 0.18
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CTXN3-202ENST00000395322 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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CTXN3-202ENST00000395322 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.16■□□□□ 0.18
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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CTXN3-202ENST00000395322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.14■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.14■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.12■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.12■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 NCOA1Q15788 1441 aa16.12■□□□□ 0.17
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CTXN3-202ENST00000395322 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.11■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.1■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.1■□□□□ 0.17
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CTXN3-202ENST00000395322 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.09■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM52Q96A61 297 aa16.09■□□□□ 0.17
CTXN3-202ENST00000395322 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.08■□□□□ 0.16
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CTXN3-202ENST00000395322 TSPY4P0CV99 314 aa16.07■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 TSPY10P0CW01 314 aa16.07■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 POTEHQ6S545 545 aa16.07■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 MBD5Q9P267 1494 aa16.06■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.06■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.06■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.06■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 NEUROD1Q13562 356 aa16.05■□□□□ 0.16
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CTXN3-202ENST00000395322 PLCH2O75038 1416 aa16.04■□□□□ 0.16
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CTXN3-202ENST00000395322 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.03■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 PLXNC1O60486 1568 aa16.02■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTXN3-202ENST00000395322 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.01■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 ABCC1P33527 1531 aa16.01■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 KDM5DQ9BY66 1539 aa16■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 KCNH8Q96L42 1107 aa15.99■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 KIF15Q9NS87 1388 aa15.99■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.98■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 PZPP20742 1482 aa15.98■□□□□ 0.15
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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