RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394588.3

NMB-202, Transcript of neuromedin B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-202ENST00000394588 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.11■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.09■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 RICTORQ6R327 1708 aa42.08■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 ADGRL1O94910 1474 aa42.07■■■■■ 4.33
NMB-202ENST00000394588 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
NMB-202ENST00000394588 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.03■■■■■ 4.32
NMB-202ENST00000394588 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.02■■■■■ 4.32
NMB-202ENST00000394588 NCOA2Q15596 1464 aa42.02■■■■■ 4.32
NMB-202ENST00000394588 RAPGEF3O95398 923 aa42■■■■■ 4.31
NMB-202ENST00000394588 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.98■■■■■ 4.31
NMB-202ENST00000394588 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
NMB-202ENST00000394588 ABCC1P33527 1531 aa41.96■■■■■ 4.31
NMB-202ENST00000394588 APLP2Q06481 763 aa41.95■■■■■ 4.31
NMB-202ENST00000394588 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.94■■■■■ 4.3
NMB-202ENST00000394588 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.94■■■■■ 4.3
NMB-202ENST00000394588 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.91■■■■■ 4.3
NMB-202ENST00000394588 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.85■■■■■ 4.29
NMB-202ENST00000394588 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
NMB-202ENST00000394588 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.82■■■■■ 4.29
NMB-202ENST00000394588 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
NMB-202ENST00000394588 KDM5CP41229 1560 aa41.8■■■■■ 4.28
NMB-202ENST00000394588 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.79■■■■■ 4.28
NMB-202ENST00000394588 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
NMB-202ENST00000394588 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.77■■■■■ 4.28
NMB-202ENST00000394588 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.75■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.74■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.74■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.72■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 AFAP1Q8N556 730 aa41.7■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.7■■■■■ 4.27
NMB-202ENST00000394588 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.69■■■■■ 4.26
NMB-202ENST00000394588 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.68■■■■■ 4.26
NMB-202ENST00000394588 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
NMB-202ENST00000394588 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.67■■■■■ 4.26
NMB-202ENST00000394588 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.25
NMB-202ENST00000394588 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.61■■■■■ 4.25
NMB-202ENST00000394588 MIA2Q96PC5 1412 aa41.6■■■■■ 4.25
NMB-202ENST00000394588 MBD5Q9P267 1494 aa41.6■■■■■ 4.25
NMB-202ENST00000394588 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.57■■■■■ 4.24
NMB-202ENST00000394588 ABCA6Q8N139 1617 aa41.56■■■■■ 4.24
NMB-202ENST00000394588 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.55■■■■■ 4.24
NMB-202ENST00000394588 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.53■■■■■ 4.24
NMB-202ENST00000394588 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
NMB-202ENST00000394588 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.5■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 ATP10AO60312 1499 aa41.5■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.48■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 ATP7AQ04656 1500 aa41.48■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.47■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.47■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.46■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.46■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.46■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
NMB-202ENST00000394588 REREQ9P2R6 1566 aa41.43■■■■■ 4.22
NMB-202ENST00000394588 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.41■■■■■ 4.22
NMB-202ENST00000394588 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
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NMB-202ENST00000394588 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.35■■■■■ 4.21
NMB-202ENST00000394588 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.34■■■■■ 4.21
NMB-202ENST00000394588 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
NMB-202ENST00000394588 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.3■■■■■ 4.2
NMB-202ENST00000394588 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.29■■■■■ 4.2
NMB-202ENST00000394588 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.29■■■■■ 4.2
NMB-202ENST00000394588 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
NMB-202ENST00000394588 AGLP35573 1532 aa41.26■■■■■ 4.2
NMB-202ENST00000394588 PLXNC1O60486 1568 aa41.25■■■■■ 4.19
NMB-202ENST00000394588 MADDQ8WXG6 1647 aa41.23■■■■■ 4.19
NMB-202ENST00000394588 A2MP01023 1474 aa41.21■■■■■ 4.19
NMB-202ENST00000394588 ABCC5O15440 1437 aa41.19■■■■■ 4.18
NMB-202ENST00000394588 TSPY4P0CV99 314 aa41.19■■■■■ 4.18
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NMB-202ENST00000394588 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.18■■■■■ 4.18
NMB-202ENST00000394588 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
NMB-202ENST00000394588 DAPK1P53355 1430 aa41.18■■■■■ 4.18
NMB-202ENST00000394588 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.14■■■■■ 4.18
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NMB-202ENST00000394588 MLECQ14165 292 aa41.12■■■■■ 4.17
NMB-202ENST00000394588 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
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NMB-202ENST00000394588 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
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NMB-202ENST00000394588 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.94■■■■■ 4.14
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NMB-202ENST00000394588 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
NMB-202ENST00000394588 KIF15Q9NS87 1388 aa40.91■■■■■ 4.14
NMB-202ENST00000394588 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.89■■■■■ 4.14
NMB-202ENST00000394588 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.88■■■■■ 4.14
NMB-202ENST00000394588 PTPRKQ15262 1439 aa40.88■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 NCOA1Q15788 1441 aa40.86■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
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NMB-202ENST00000394588 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.84■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 MROH2AA6NES4 1674 aa40.83■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 GGT6Q6P531 493 aa40.82■■■■■ 4.13
NMB-202ENST00000394588 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.82■■■■■ 4.12
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