RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383282.3

NPHP3-202, Transcript of nephrocystin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3, Length 782 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-202ENST00000383282 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.2■■■■■ 4.51
NPHP3-202ENST00000383282 KIF14Q15058 1648 aa43.19■■■■■ 4.5
NPHP3-202ENST00000383282 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.17■■■■■ 4.5
NPHP3-202ENST00000383282 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
NPHP3-202ENST00000383282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.16■■■■■ 4.5
NPHP3-202ENST00000383282 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.06■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.06■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.05■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.02■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
NPHP3-202ENST00000383282 MLECQ14165 292 aa42.99■■■■■ 4.47
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.99■■■■■ 4.47
NPHP3-202ENST00000383282 ATP10AO60312 1499 aa42.98■■■■■ 4.47
NPHP3-202ENST00000383282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.96■■■■■ 4.47
NPHP3-202ENST00000383282 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.95■■■■■ 4.47
NPHP3-202ENST00000383282 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.92■■■■■ 4.46
NPHP3-202ENST00000383282 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.9■■■■■ 4.46
NPHP3-202ENST00000383282 AFAP1Q8N556 730 aa42.9■■■■■ 4.46
NPHP3-202ENST00000383282 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.9■■■■■ 4.46
NPHP3-202ENST00000383282 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.89■■■■■ 4.46
NPHP3-202ENST00000383282 KDM5CP41229 1560 aa42.86■■■■■ 4.45
NPHP3-202ENST00000383282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.83■■■■■ 4.45
NPHP3-202ENST00000383282 PREX2Q70Z35 1606 aa42.82■■■■■ 4.44
NPHP3-202ENST00000383282 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.81■■■■■ 4.44
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.78■■■■■ 4.44
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC1P33527 1531 aa42.74■■■■■ 4.43
NPHP3-202ENST00000383282 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.73■■■■■ 4.43
NPHP3-202ENST00000383282 HSPA2P54652 639 aa42.7■■■■■ 4.43
NPHP3-202ENST00000383282 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.7■■■■■ 4.43
NPHP3-202ENST00000383282 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.69■■■■■ 4.43
NPHP3-202ENST00000383282 REREQ9P2R6 1566 aa42.65■■■■■ 4.42
NPHP3-202ENST00000383282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.64■■■■■ 4.42
NPHP3-202ENST00000383282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.64■■■■■ 4.42
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
NPHP3-202ENST00000383282 ABCA6Q8N139 1617 aa42.61■■■■■ 4.41
NPHP3-202ENST00000383282 FBXO41Q8TF61 875 aa42.6■■■■■ 4.41
NPHP3-202ENST00000383282 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
NPHP3-202ENST00000383282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
NPHP3-202ENST00000383282 AGLP35573 1532 aa42.54■■■■■ 4.4
NPHP3-202ENST00000383282 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.53■■■■■ 4.4
NPHP3-202ENST00000383282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
NPHP3-202ENST00000383282 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.51■■■■■ 4.4
NPHP3-202ENST00000383282 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.5■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.48■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.48■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.47■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.45■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
NPHP3-202ENST00000383282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.38
NPHP3-202ENST00000383282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.43■■■■■ 4.38
NPHP3-202ENST00000383282 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.42■■■■■ 4.38
NPHP3-202ENST00000383282 CEP162Q5TB80 1403 aa42.38■■■■■ 4.38
NPHP3-202ENST00000383282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.35■■■■■ 4.37
NPHP3-202ENST00000383282 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.33■■■■■ 4.37
NPHP3-202ENST00000383282 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.36
NPHP3-202ENST00000383282 ATP7AQ04656 1500 aa42.3■■■■■ 4.36
NPHP3-202ENST00000383282 C3P01024 1663 aa42.3■■■■■ 4.36
NPHP3-202ENST00000383282 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.27■■■■■ 4.36
NPHP3-202ENST00000383282 TIAM1Q13009 1591 aa42.24■■■■■ 4.35
NPHP3-202ENST00000383282 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
NPHP3-202ENST00000383282 A2MP01023 1474 aa42.21■■■■■ 4.35
NPHP3-202ENST00000383282 CERKQ8TCT0 537 aa42.2■■■■■ 4.35
NPHP3-202ENST00000383282 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
NPHP3-202ENST00000383282 PLXNC1O60486 1568 aa42.14■■■■■ 4.34
NPHP3-202ENST00000383282 ZMYM3Q14202 1370 aa42.13■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 MROH2AA6NES4 1674 aa42.12■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 STRCQ7RTU9 1775 aa42.11■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 NPATQ14207 1427 aa42.11■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 MBD5Q9P267 1494 aa42.11■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 GGT6Q6P531 493 aa42.09■■■■■ 4.33
NPHP3-202ENST00000383282 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.06■■■■■ 4.32
NPHP3-202ENST00000383282 NCOA2Q15596 1464 aa42.05■■■■■ 4.32
NPHP3-202ENST00000383282 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.04■■■■■ 4.32
NPHP3-202ENST00000383282 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.03■■■■■ 4.32
NPHP3-202ENST00000383282 PTPRTO14522 1441 aa42.02■■■■■ 4.32
NPHP3-202ENST00000383282 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.98■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.98■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.96■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.96■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 NCOA1Q15788 1441 aa41.95■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.95■■■■■ 4.31
NPHP3-202ENST00000383282 PTPRKQ15262 1439 aa41.89■■■■■ 4.3
NPHP3-202ENST00000383282 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.87■■■■■ 4.29
NPHP3-202ENST00000383282 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.85■■■■■ 4.29
NPHP3-202ENST00000383282 KIF3BO15066 747 aa41.83■■■■■ 4.29
NPHP3-202ENST00000383282 TSPY4P0CV99 314 aa41.83■■■■■ 4.29
NPHP3-202ENST00000383282 TSPY10P0CW01 314 aa41.83■■■■■ 4.29
NPHP3-202ENST00000383282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.81■■■■■ 4.28
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.78■■■■■ 4.28
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
NPHP3-202ENST00000383282 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
NPHP3-202ENST00000383282 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.74■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 PLA2R1Q13018 1463 aa41.74■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 MAP3K1Q13233 1512 aa41.74■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 PKD2Q13563 968 aa41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms