RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 ADGRL1O94910 1474 aa11.71□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 ARID3CA6NKF2 412 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.69□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.68□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 KIF21BO75037 1637 aa11.67□□□□□ -0.54
CTXN3-201ENST00000379445 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.66□□□□□ -0.54
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CTXN3-201ENST00000379445 NEO1Q92859 1461 aa11.61□□□□□ -0.55
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CTXN3-201ENST00000379445 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.54□□□□□ -0.56
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CTXN3-201ENST00000379445 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.46□□□□□ -0.57
CTXN3-201ENST00000379445 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.46□□□□□ -0.58
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CTXN3-201ENST00000379445 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 KIF14Q15058 1648 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 MADDQ8WXG6 1647 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-201ENST00000379445 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
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CTXN3-201ENST00000379445 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.4□□□□□ -0.59
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CTXN3-201ENST00000379445 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 KDM5CP41229 1560 aa11.38□□□□□ -0.59
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CTXN3-201ENST00000379445 FKBP8Q14318 412 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 ATP10AO60312 1499 aa11.36□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 PREX2Q70Z35 1606 aa11.35□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.35□□□□□ -0.59
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CTXN3-201ENST00000379445 ABCC1P33527 1531 aa11.34□□□□□ -0.59
CTXN3-201ENST00000379445 BCANQ96GW7 911 aa11.33□□□□□ -0.6
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CTXN3-201ENST00000379445 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.33□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.33□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 REREQ9P2R6 1566 aa11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.32□□□□□ -0.6
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CTXN3-201ENST00000379445 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.3□□□□□ -0.6
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CTXN3-201ENST00000379445 SPDYE6P0CI01 402 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.29□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.29□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA2P54652 639 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 PLCB2Q00722 1185 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 AGLP35573 1532 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.28□□□□□ -0.6
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