RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376808.8

NMRK1-202, Transcript of nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMRK1, Length 1,121 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1-202ENST00000376808 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.67■■■□□ 2.34
NMRK1-202ENST00000376808 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.67■■■□□ 2.34
NMRK1-202ENST00000376808 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.67■■■□□ 2.34
NMRK1-202ENST00000376808 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.67■■■□□ 2.34
NMRK1-202ENST00000376808 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.65■■■□□ 2.34
NMRK1-202ENST00000376808 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.63■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 AFAP1Q8N556 730 aa29.63■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.61■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.61■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.6■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.59■■■□□ 2.33
NMRK1-202ENST00000376808 MLECQ14165 292 aa29.55■■■□□ 2.32
NMRK1-202ENST00000376808 MADDQ8WXG6 1647 aa29.54■■■□□ 2.32
NMRK1-202ENST00000376808 ATP10AO60312 1499 aa29.54■■■□□ 2.32
NMRK1-202ENST00000376808 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.52■■■□□ 2.32
NMRK1-202ENST00000376808 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.51■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.48■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.47■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.47■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.46■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.46■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.46■■■□□ 2.31
NMRK1-202ENST00000376808 KDM5CP41229 1560 aa29.44■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 CEP162Q5TB80 1403 aa29.43■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 PREX2Q70Z35 1606 aa29.42■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.41■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.4■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 ABCC1P33527 1531 aa29.4■■■□□ 2.3
NMRK1-202ENST00000376808 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.37■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.35■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.33■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.33■■■□□ 2.29
NMRK1-202ENST00000376808 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.32■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 HSPA2P54652 639 aa29.3■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.28■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.27■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.27■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 ABCA6Q8N139 1617 aa29.27■■■□□ 2.28
NMRK1-202ENST00000376808 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 REREQ9P2R6 1566 aa29.26■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.24■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 AGLP35573 1532 aa29.22■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.21■■■□□ 2.27
NMRK1-202ENST00000376808 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.2■■■□□ 2.26
NMRK1-202ENST00000376808 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.2■■■□□ 2.26
NMRK1-202ENST00000376808 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.18■■■□□ 2.26
NMRK1-202ENST00000376808 TIAM1Q13009 1591 aa29.14■■■□□ 2.26
NMRK1-202ENST00000376808 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NMRK1-202ENST00000376808 MBD5Q9P267 1494 aa29.12■■■□□ 2.25
NMRK1-202ENST00000376808 FBXO41Q8TF61 875 aa29.11■■■□□ 2.25
NMRK1-202ENST00000376808 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.11■■■□□ 2.25
NMRK1-202ENST00000376808 NCOA2Q15596 1464 aa29.09■■■□□ 2.25
NMRK1-202ENST00000376808 ATP7AQ04656 1500 aa29.08■■■□□ 2.25
NMRK1-202ENST00000376808 A2MP01023 1474 aa29.05■■■□□ 2.24
NMRK1-202ENST00000376808 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NMRK1-202ENST00000376808 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NMRK1-202ENST00000376808 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.03■■■□□ 2.24
NMRK1-202ENST00000376808 GGT6Q6P531 493 aa29.01■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.01■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 ZMYM3Q14202 1370 aa29■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.99■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 PLXNC1O60486 1568 aa28.98■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.98■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 C3P01024 1663 aa28.96■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.96■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
NMRK1-202ENST00000376808 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.95■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.92■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.91■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 MAP3K1Q13233 1512 aa28.9■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
NMRK1-202ENST00000376808 TSPY4P0CV99 314 aa28.88■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 TSPY10P0CW01 314 aa28.88■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.88■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 NPATQ14207 1427 aa28.87■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 KIF3BO15066 747 aa28.86■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 CERKQ8TCT0 537 aa28.84■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 PTPRKQ15262 1439 aa28.83■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.83■■■□□ 2.21
NMRK1-202ENST00000376808 MROH2AA6NES4 1674 aa28.81■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 STRCQ7RTU9 1775 aa28.8■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.79■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.78■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 MIA2Q96PC5 1412 aa28.78■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 APLP2Q06481 763 aa28.77■■■□□ 2.2
NMRK1-202ENST00000376808 PTPRTO14522 1441 aa28.76■■■□□ 2.19
NMRK1-202ENST00000376808 NCOA1Q15788 1441 aa28.75■■■□□ 2.19
NMRK1-202ENST00000376808 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
NMRK1-202ENST00000376808 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.72■■■□□ 2.19
NMRK1-202ENST00000376808 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms