RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368494.3

NUS1-201, Transcript of NUS1, dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUS1, Length 4,676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1-201ENST00000368494 KIF21BO75037 1637 aa21.69■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 NUP155O75694 1391 aa21.69■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 PRDM2Q13029 1718 aa21.67■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.66■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 ARAP1Q96P48 1450 aa21.64■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 PLEKHG5O94827 1062 aa21.62■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.62■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 CCER2I3L3R5 266 aa21.62■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NUS1-201ENST00000368494 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 SYNJ2O15056 1496 aa21.58■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.57■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.57■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.57■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.56■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 POGKQ9P215 609 aa21.55■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.53■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NUS1-201ENST00000368494 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.52■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 GRIN2AQ12879 1464 aa21.51■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.5■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.49■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.48■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 CDCA8Q53HL2 280 aa21.47■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.46■■□□□ 1.03
NUS1-201ENST00000368494 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.025e-7■■■■□ 21.2
NUS1-201ENST00000368494 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 AFAP1Q8N556 730 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 IQGAP2Q13576 1575 aa21.44■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 NCOA2Q15596 1464 aa21.43■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 STK26Q9P289 416 aa21.42■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.41■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 CUL7Q14999 1698 aa21.41■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NUS1-201ENST00000368494 UACAQ9BZF9 1416 aa21.38■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 NEUROD2Q15784 382 aa21.36■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.35■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.35■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 KIF15Q9NS87 1388 aa21.34■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.33■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.33■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 TMF1P82094 1093 aa21.33■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NUS1-201ENST00000368494 CFAP53Q96M91 514 aa21.32■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 ARXQ96QS3 562 aa21.29■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.28■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.27■■□□□ 1
NUS1-201ENST00000368494 RAPGEF3O95398 923 aa21.26■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 EID1Q9Y6B2 187 aa21.26■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 HECW1Q76N89 1606 aa21.26■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 RGS3P49796 1198 aa21.25■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.24■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 A0A0G2JS52 829 aa21.22■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.22■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
NUS1-201ENST00000368494 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.2■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.19■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.19■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 TIAM1Q13009 1591 aa21.18■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 BECN1Q14457 450 aa21.18■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.18■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 SOX12O15370 315 aa21.17■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 WDR62O43379 1518 aa21.16■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
NUS1-201ENST00000368494 RALBP1Q15311 655 aa21.14■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 ARHGEF11O15085 1522 aa21.13■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 NUDCQ9Y266 331 aa21.13■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.13■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.13■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 MIA2Q96PC5 1412 aa21.12■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.11■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.1■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 CD109Q6YHK3 1445 aa21.09■□□□□ 0.97
NUS1-201ENST00000368494 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms