RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.86■■□□□ 1.57
NSL1-201ENST00000366976 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.85■■□□□ 1.57
NSL1-201ENST00000366976 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.84■■□□□ 1.57
NSL1-201ENST00000366976 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.82■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.82■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.82■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.81■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 RICTORQ6R327 1708 aa24.81■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.78■■□□□ 1.56
NSL1-201ENST00000366976 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.76■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.76■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.74■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.74■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 PTPRMP28827 1452 aa24.73■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.73■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 FBXO41Q8TF61 875 aa24.73■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 PREX2Q70Z35 1606 aa24.72■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.71■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.71■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NSL1-201ENST00000366976 MADDQ8WXG6 1647 aa24.69■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.68■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 MAP3K1Q13233 1512 aa24.67■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.67■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 KDM5CP41229 1560 aa24.67■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.67■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.66■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.65■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.64■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.64■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 AFAP1Q8N556 730 aa24.64■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
NSL1-201ENST00000366976 ATP10AO60312 1499 aa24.64■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 ABCC1P33527 1531 aa24.63■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.61■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 TIAM1Q13009 1591 aa24.59■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.58■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.58■■□□□ 1.53
NSL1-201ENST00000366976 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.57■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.56■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 REREQ9P2R6 1566 aa24.55■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.54■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.53■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.53■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.53■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NSL1-201ENST00000366976 NCOA2Q15596 1464 aa24.51■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.51■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.5■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 AGLP35573 1532 aa24.48■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 24.7
NSL1-201ENST00000366976 APLP2Q06481 763 aa24.47■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.47■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.46■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.46■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 MBD5Q9P267 1494 aa24.45■■□□□ 1.51
NSL1-201ENST00000366976 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.44■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.44■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 ADRA2BP18089 450 aa24.43■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.43■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 MIA2Q96PC5 1412 aa24.41■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 ABCA6Q8N139 1617 aa24.39■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
NSL1-201ENST00000366976 HSPA2P54652 639 aa24.39■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 ATP7AQ04656 1500 aa24.37■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.35■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.33■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.33■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 MLECQ14165 292 aa24.33■■□□□ 1.49
NSL1-201ENST00000366976 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.32■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 TSPY4P0CV99 314 aa24.31■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 TSPY10P0CW01 314 aa24.31■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 A2MP01023 1474 aa24.31■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.3■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.29■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 PLXNC1O60486 1568 aa24.29■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NSL1-201ENST00000366976 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.25■■□□□ 1.47
NSL1-201ENST00000366976 CERKQ8TCT0 537 aa24.25■■□□□ 1.47
NSL1-201ENST00000366976 STRCQ7RTU9 1775 aa24.21■■□□□ 1.47
NSL1-201ENST00000366976 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.2■■□□□ 1.46
NSL1-201ENST00000366976 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NSL1-201ENST00000366976 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.16■■□□□ 1.46
NSL1-201ENST00000366976 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.16■■□□□ 1.46
NSL1-201ENST00000366976 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NSL1-201ENST00000366976 MROH2AA6NES4 1674 aa24.14■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 NPATQ14207 1427 aa24.13■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 ZMYM3Q14202 1370 aa24.13■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.13■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 GGT6Q6P531 493 aa24.11■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NSL1-201ENST00000366976 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms