RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD1Q16676 465 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 NUP155O75694 1391 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.96■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 FGD1P98174 961 aa25.95■■□□□ 1.75
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ4P48050 445 aa25.95■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.95■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC8Q09428 1581 aa25.95■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 SOX12O15370 315 aa25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 RALBP1Q15311 655 aa25.91■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 STK26Q9P289 416 aa25.91■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.9■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 NPHP1O15259 732 aa25.9■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CCSAP-203ENST00000366687 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP44Q96MT7 982 aa25.87■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 HSCBQ8IWL3 235 aa25.86■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.84■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-203ENST00000366687 MCCP23508 829 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA2Q08379 1002 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 PLCB2Q00722 1185 aa25.8■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 KIF3BO15066 747 aa25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.77■■□□□ 1.72
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.76■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.75■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 NRDCO43847 1150 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.715e-7■■□□□ 13.3
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.7■■□□□ 1.71
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP13Q86W25 1043 aa25.7■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.7■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 JPH4Q96JJ6 628 aa25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.65■■□□□ 1.7
CCSAP-203ENST00000366687 APBB1O00213 710 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 PDE3BQ13370 1112 aa25.63■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.61■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 STK31Q9BXU1 1019 aa25.6■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.57■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.57■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.56■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 EID1Q9Y6B2 187 aa25.55■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 WIZO95785 1651 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.54■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 GBP4Q96PP9 640 aa25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.52■■□□□ 1.68
CCSAP-203ENST00000366687 HMMRO75330 724 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.51■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.49■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 PTMSP20962 102 aa25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.47■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 KIF15Q9NS87 1388 aa25.47■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.46■■□□□ 1.67
CCSAP-203ENST00000366687 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 AMPHP49418 695 aa25.42■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH3Q96I76 525 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 PANK3Q9H999 370 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 DRC7Q8IY82 874 aa25.4■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCSAP-203ENST00000366687 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 GORABQ5T7V8 394 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms