RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 PREX2Q70Z35 1606 aa42.86■■■■■ 4.45
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TPGS1-201ENST00000359315 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.83■■■■■ 4.45
TPGS1-201ENST00000359315 RICTORQ6R327 1708 aa42.81■■■■■ 4.44
TPGS1-201ENST00000359315 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
TPGS1-201ENST00000359315 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.79■■■■■ 4.44
TPGS1-201ENST00000359315 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.77■■■■■ 4.44
TPGS1-201ENST00000359315 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.75■■■■■ 4.43
TPGS1-201ENST00000359315 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.72■■■■■ 4.43
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.71■■■■■ 4.43
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.69■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.68■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC1P33527 1531 aa42.67■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K1Q13233 1512 aa42.66■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.65■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 NCOA2Q15596 1464 aa42.65■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.63■■■■■ 4.42
TPGS1-201ENST00000359315 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.62■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 AFAP1Q8N556 730 aa42.62■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.61■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.59■■■■■ 4.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.58■■■■■ 4.41
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TPGS1-201ENST00000359315 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.55■■■■■ 4.4
TPGS1-201ENST00000359315 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.54■■■■■ 4.4
TPGS1-201ENST00000359315 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.52■■■■■ 4.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
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TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.43■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.41■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.41■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.41■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.39■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
TPGS1-201ENST00000359315 ATP10AO60312 1499 aa42.36■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.35■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 MBD5Q9P267 1494 aa42.33■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.33■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.32■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.32■■■■■ 4.37
TPGS1-201ENST00000359315 ABCA6Q8N139 1617 aa42.31■■■■■ 4.36
TPGS1-201ENST00000359315 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.27■■■■■ 4.36
TPGS1-201ENST00000359315 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.27■■■■■ 4.36
TPGS1-201ENST00000359315 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.25■■■■■ 4.35
TPGS1-201ENST00000359315 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
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TPGS1-201ENST00000359315 MLECQ14165 292 aa42.17■■■■■ 4.34
TPGS1-201ENST00000359315 MIA2Q96PC5 1412 aa42.16■■■■■ 4.34
TPGS1-201ENST00000359315 MADDQ8WXG6 1647 aa42.16■■■■■ 4.34
TPGS1-201ENST00000359315 REREQ9P2R6 1566 aa42.15■■■■■ 4.34
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.14■■■■■ 4.34
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TPGS1-201ENST00000359315 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.03■■■■■ 4.32
TPGS1-201ENST00000359315 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.02■■■■■ 4.32
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TPGS1-201ENST00000359315 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
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TPGS1-201ENST00000359315 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.98■■■■■ 4.31
TPGS1-201ENST00000359315 PLXNC1O60486 1568 aa41.97■■■■■ 4.31
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TPGS1-201ENST00000359315 TSPY10P0CW01 314 aa41.88■■■■■ 4.29
TPGS1-201ENST00000359315 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.86■■■■■ 4.29
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC5O15440 1437 aa41.86■■■■■ 4.29
TPGS1-201ENST00000359315 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.85■■■■■ 4.29
TPGS1-201ENST00000359315 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.84■■■■■ 4.29
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TPGS1-201ENST00000359315 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.72■■■■■ 4.27
TPGS1-201ENST00000359315 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
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TPGS1-201ENST00000359315 KIF3BO15066 747 aa41.67■■■■■ 4.26
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TPGS1-201ENST00000359315 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.57■■■■■ 4.25
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TPGS1-201ENST00000359315 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.54■■■■■ 4.24
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRKQ15262 1439 aa41.53■■■■■ 4.24
TPGS1-201ENST00000359315 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
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TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.5■■■■■ 4.23
TPGS1-201ENST00000359315 NCOA1Q15788 1441 aa41.49■■■■■ 4.23
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