RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 ATP10BO94823 1461 aa22.58■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 PKD2Q13563 968 aa22.58■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.57■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.57■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 CHD1O14646 1710 aa22.57■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 KIF3BO15066 747 aa22.56■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 HECW1Q76N89 1606 aa22.55■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 NUP155O75694 1391 aa22.53■■□□□ 1.2
PDGFB-201ENST00000331163 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 PTPRKQ15262 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.45■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.45■■□□□ 1.19
PDGFB-201ENST00000331163 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.45■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 SAMD9Q5K651 1589 aa22.45■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.45■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 BCANQ96GW7 911 aa22.44■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.4■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 MIER1Q8N108 512 aa22.39■■□□□ 1.18
PDGFB-201ENST00000331163 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.38■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 KIF15Q9NS87 1388 aa22.37■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.36■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.34■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PDGFB-201ENST00000331163 ASXL2Q76L83 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 ABCC5O15440 1437 aa22.3■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 DAPK1P53355 1430 aa22.3■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 NAIPQ13075 1403 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 KIF14Q15058 1648 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.27■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 MAP3K1Q13233 1512 aa22.27■■□□□ 1.16
PDGFB-201ENST00000331163 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.26■■□□□ 1.15
PDGFB-201ENST00000331163 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.25■■□□□ 1.15
PDGFB-201ENST00000331163 CD109Q6YHK3 1445 aa22.24■■□□□ 1.15
PDGFB-201ENST00000331163 MIA2Q96PC5 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
PDGFB-201ENST00000331163 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.22■■□□□ 1.15
PDGFB-201ENST00000331163 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.18■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 ABCC2Q92887 1545 aa22.18■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 HFM1A2PYH4 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
PDGFB-201ENST00000331163 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.14■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 NCOA1Q15788 1441 aa22.13■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 FANCAO15360 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 ABCA8O94911 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.12■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.1■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 ADGRL1O94910 1474 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 KANK1Q14678 1352 aa22.08■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDGFB-201ENST00000331163 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.06■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 STK26Q9P289 416 aa22.05■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 PLCH2O75038 1416 aa22.05■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 PLEKHG5O94827 1062 aa22.05■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.04■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 AKNAQ7Z591 1439 aa22.02■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 ANP32CO43423 234 aa22.02■■□□□ 1.12
PDGFB-201ENST00000331163 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.02■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.01■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.96■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.96■■□□□ 1.11
PDGFB-201ENST00000331163 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 TMC1Q8TDI8 760 aa21.91■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 KDM6BO15054 1643 aa21.91■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 ROCK1Q13464 1354 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.89■■□□□ 1.1
PDGFB-201ENST00000331163 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.89■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.89■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.88■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 MAPKBP1O60336 1514 aa21.86■■□□□ 1.09
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.85■■□□□ 1.09
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