RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.69■■■□□ 2.18
HDDC3-201ENST00000330334 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
HDDC3-201ENST00000330334 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.67■■■□□ 2.18
HDDC3-201ENST00000330334 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.64■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.63■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.62■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.61■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 PTPRMP28827 1452 aa28.6■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.59■■■□□ 2.17
HDDC3-201ENST00000330334 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.55■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 ATP10AO60312 1499 aa28.55■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 AFAP1Q8N556 730 aa28.55■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.54■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 CEP162Q5TB80 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 PREX2Q70Z35 1606 aa28.52■■■□□ 2.16
HDDC3-201ENST00000330334 KDM5CP41229 1560 aa28.51■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 MADDQ8WXG6 1647 aa28.49■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.49■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.46■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 ABCC1P33527 1531 aa28.45■■■□□ 2.15
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.44■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.44■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.44■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.43■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 MLECQ14165 292 aa28.39■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.39■■■□□ 2.14
HDDC3-201ENST00000330334 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.38■■■□□ 2.13
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HDDC3-201ENST00000330334 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.37■■■□□ 2.13
HDDC3-201ENST00000330334 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.37■■■□□ 2.13
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HDDC3-201ENST00000330334 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.35■■■□□ 2.13
HDDC3-201ENST00000330334 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.34■■■□□ 2.13
HDDC3-201ENST00000330334 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
HDDC3-201ENST00000330334 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.33■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.32■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 AGLP35573 1532 aa28.29■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 ABCA6Q8N139 1617 aa28.29■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.27■■■□□ 2.12
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HDDC3-201ENST00000330334 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.27■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.27■■■□□ 2.12
HDDC3-201ENST00000330334 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.24■■■□□ 2.11
HDDC3-201ENST00000330334 TIAM1Q13009 1591 aa28.22■■■□□ 2.11
HDDC3-201ENST00000330334 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.2■■■□□ 2.1
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HDDC3-201ENST00000330334 NCOA2Q15596 1464 aa28.16■■■□□ 2.1
HDDC3-201ENST00000330334 MBD5Q9P267 1494 aa28.16■■■□□ 2.1
HDDC3-201ENST00000330334 ATP7AQ04656 1500 aa28.15■■■□□ 2.1
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HDDC3-201ENST00000330334 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.11■■■□□ 2.09
HDDC3-201ENST00000330334 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.11■■■□□ 2.09
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.11■■■□□ 2.09
HDDC3-201ENST00000330334 HSPA2P54652 639 aa28.11■■■□□ 2.09
HDDC3-201ENST00000330334 A2MP01023 1474 aa28.09■■■□□ 2.09
HDDC3-201ENST00000330334 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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HDDC3-201ENST00000330334 PLXNC1O60486 1568 aa28.07■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.05■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.03■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.02■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.02■■■□□ 2.08
HDDC3-201ENST00000330334 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.01■■■□□ 2.07
HDDC3-201ENST00000330334 C3P01024 1663 aa28■■■□□ 2.07
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HDDC3-201ENST00000330334 ZMYM3Q14202 1370 aa27.99■■■□□ 2.07
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HDDC3-201ENST00000330334 NPATQ14207 1427 aa27.96■■■□□ 2.07
HDDC3-201ENST00000330334 TSPY4P0CV99 314 aa27.95■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 TSPY10P0CW01 314 aa27.95■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 GGT6Q6P531 493 aa27.95■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.94■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 MROH2AA6NES4 1674 aa27.94■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 MIA2Q96PC5 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 APLP2Q06481 763 aa27.92■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.91■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.91■■■□□ 2.06
HDDC3-201ENST00000330334 FBXO41Q8TF61 875 aa27.87■■■□□ 2.05
HDDC3-201ENST00000330334 KIF3BO15066 747 aa27.85■■■□□ 2.05
HDDC3-201ENST00000330334 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
HDDC3-201ENST00000330334 PTPRKQ15262 1439 aa27.83■■■□□ 2.05
HDDC3-201ENST00000330334 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.8■■■□□ 2.04
HDDC3-201ENST00000330334 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.8■■■□□ 2.04
HDDC3-201ENST00000330334 STRCQ7RTU9 1775 aa27.8■■■□□ 2.04
HDDC3-201ENST00000330334 PTPRTO14522 1441 aa27.77■■■□□ 2.04
HDDC3-201ENST00000330334 NCOA1Q15788 1441 aa27.75■■■□□ 2.03
HDDC3-201ENST00000330334 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.74■■■□□ 2.03
HDDC3-201ENST00000330334 CERKQ8TCT0 537 aa27.73■■■□□ 2.03
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