RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.61■■□□□ 1.37
SEPHS1-201ENST00000327347 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.58■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF11O15085 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.56■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.56■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 NCOA1Q15788 1441 aa23.53■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 HECW1Q76N89 1606 aa23.52■■□□□ 1.36
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.51■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.51■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 DAPK1P53355 1430 aa23.47■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.47■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 IQGAP2Q13576 1575 aa23.47■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.46■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC5O15440 1437 aa23.46■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 MIA2Q96PC5 1412 aa23.46■■□□□ 1.35
SEPHS1-201ENST00000327347 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.44■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 AKNAQ7Z591 1439 aa23.41■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR62O43379 1518 aa23.41■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.4■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SEPHS1-201ENST00000327347 PKD2Q13563 968 aa23.39■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 FBLN2P98095 1184 aa23.39■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.39■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.35■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.34■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 USP47Q96K76 1375 aa23.34■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 PBRM1Q86U86 1689 aa23.34■■□□□ 1.33
SEPHS1-201ENST00000327347 ROCK1Q13464 1354 aa23.32■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 ADAMTS12P58397 1594 aa23.31■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.3■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 TMC1Q8TDI8 760 aa23.29■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 PZPP20742 1482 aa23.27■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.27■■□□□ 1.32
SEPHS1-201ENST00000327347 NUDCQ9Y266 331 aa23.26■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 DISP1Q96F81 1524 aa23.25■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.23■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.22■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.21■■□□□ 1.31
SEPHS1-201ENST00000327347 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 NUP155O75694 1391 aa23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.2■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA0556O60303 1618 aa23.19■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 SKAP1Q86WV1 359 aa23.17■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.17■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.15■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.15■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.14■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 RGL3Q3MIN7 710 aa23.14■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.14■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF14Q15058 1648 aa23.12■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 MBD5Q9P267 1494 aa23.09■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.09■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 GRIN2AQ12879 1464 aa23.08■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TSPY4P0CV99 314 aa23.08■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 TSPY10P0CW01 314 aa23.08■■□□□ 1.29
SEPHS1-201ENST00000327347 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.06■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 JPH4Q96JJ6 628 aa23.06■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 IL27Q8NEV9 243 aa23.04■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM5CP41229 1560 aa23.03■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 IFT140Q96RY7 1462 aa23.03■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF15Q9NS87 1388 aa23.03■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.02■■□□□ 1.28
SEPHS1-201ENST00000327347 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.01■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CDCA7LQ96GN5 454 aa23■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms