RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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CLVS1-201ENST00000325897 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 WDR62O43379 1518 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 TIAM1Q13009 1591 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLVS1-201ENST00000325897 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 PBRM1Q86U86 1689 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLVS1-201ENST00000325897 MAP3K1Q13233 1512 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-201ENST00000325897 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLVS1-201ENST00000325897 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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CLVS1-201ENST00000325897 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-201ENST00000325897 PLCB2Q00722 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-201ENST00000325897 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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CLVS1-201ENST00000325897 CFAP44Q96MT7 982 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLVS1-201ENST00000325897 CEP170Q5SW79 1584 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 FOXD1Q16676 465 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 RGS3P49796 1198 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 NUP160Q12769 1436 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-201ENST00000325897 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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