RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323460.9

SENP5-201, Transcript of SUMO specific peptidase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP5, Length 6,308 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP5-201ENST00000323460 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SENP5-201ENST00000323460 FOXD1Q16676 465 aa22.34■■□□□ 1.17
SENP5-201ENST00000323460 RGS3P49796 1198 aa22.33■■□□□ 1.17
SENP5-201ENST00000323460 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
SENP5-201ENST00000323460 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SENP5-201ENST00000323460 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.3■■□□□ 1.16
SENP5-201ENST00000323460 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.164e-7■■■■□ 22.2
SENP5-201ENST00000323460 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.3■■□□□ 1.16
SENP5-201ENST00000323460 RALBP1Q15311 655 aa22.28■■□□□ 1.16
SENP5-201ENST00000323460 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 STK26Q9P289 416 aa22.26■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 KIF3BO15066 747 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 JPH4Q96JJ6 628 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 SMARCA4P51532 1647 aa22.23■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.22■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 SOX12O15370 315 aa22.21■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SENP5-201ENST00000323460 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.18■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.16■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.15■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 CFAP44Q96MT7 982 aa22.15■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 NPHP1O15259 732 aa22.15■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
SENP5-201ENST00000323460 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 KCNJ4P48050 445 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 FGD1P98174 961 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP5-201ENST00000323460 MCCP23508 829 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 HSCBQ8IWL3 235 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 GOLGA2Q08379 1002 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 EID1Q9Y6B2 187 aa22.05■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 NLRP13Q86W25 1043 aa22.04■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 PTPRGP23470 1445 aa22.04■■□□□ 1.12
SENP5-201ENST00000323460 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.99■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 PDE3BQ13370 1112 aa21.98■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.98■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.98■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 UACAQ9BZF9 1416 aa21.97■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.95■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
SENP5-201ENST00000323460 STK31Q9BXU1 1019 aa21.94■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 KIF15Q9NS87 1388 aa21.94■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 IGF1RP08069 1367 aa21.93■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.93■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.93■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.92■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.92■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.92■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.91■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.91■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.9■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.89■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.89■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
SENP5-201ENST00000323460 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.89■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 APBB1O00213 710 aa21.88■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 PLCB2Q00722 1185 aa21.88■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.87■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 NRDCO43847 1150 aa21.86■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 HMMRO75330 724 aa21.85■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.84■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 AMPHP49418 695 aa21.84■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 PANK3Q9H999 370 aa21.83■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 NCAPD3P42695 1498 aa21.83■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.83■■□□□ 1.09
SENP5-201ENST00000323460 OSCARQ8IYS5 282 aa21.83■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 EVC2Q86UK5 1308 aa21.8■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.79■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 USP47Q96K76 1375 aa21.78■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.78■■□□□ 1.08
SENP5-201ENST00000323460 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms