RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300260.7

C21orf59-202, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C21orf59, Length 1,243 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59-202ENST00000300260 PREX2Q70Z35 1606 aa28.18■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 ADGRL1O94910 1474 aa28.17■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.17■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.16■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.15■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.14■■■□□ 2.1
C21orf59-202ENST00000300260 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.11■■■□□ 2.09
C21orf59-202ENST00000300260 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
C21orf59-202ENST00000300260 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
C21orf59-202ENST00000300260 NCOA2Q15596 1464 aa28.09■■■□□ 2.09
C21orf59-202ENST00000300260 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
C21orf59-202ENST00000300260 RICTORQ6R327 1708 aa28.07■■■□□ 2.08
C21orf59-202ENST00000300260 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.07■■■□□ 2.08
C21orf59-202ENST00000300260 ABCC1P33527 1531 aa28.02■■■□□ 2.08
C21orf59-202ENST00000300260 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 AFAP1Q8N556 730 aa28■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.99■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.99■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
C21orf59-202ENST00000300260 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.94■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.93■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 KDM5CP41229 1560 aa27.92■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.92■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.92■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.92■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.9■■■□□ 2.06
C21orf59-202ENST00000300260 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.88■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.87■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.86■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.85■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.85■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 MIA2Q96PC5 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 MBD5Q9P267 1494 aa27.83■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
C21orf59-202ENST00000300260 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
C21orf59-202ENST00000300260 ATP10AO60312 1499 aa27.82■■■□□ 2.04
C21orf59-202ENST00000300260 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.78■■■□□ 2.04
C21orf59-202ENST00000300260 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
C21orf59-202ENST00000300260 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.77■■■□□ 2.04
C21orf59-202ENST00000300260 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.75■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.75■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.74■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 ABCA6Q8N139 1617 aa27.74■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.73■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 ATP7AQ04656 1500 aa27.72■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.71■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.7■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
C21orf59-202ENST00000300260 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.69■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.68■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 TSPY4P0CV99 314 aa27.68■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 TSPY10P0CW01 314 aa27.68■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 REREQ9P2R6 1566 aa27.67■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.67■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 MLECQ14165 292 aa27.65■■■□□ 2.02
C21orf59-202ENST00000300260 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.62■■■□□ 2.01
C21orf59-202ENST00000300260 AGLP35573 1532 aa27.6■■■□□ 2.01
C21orf59-202ENST00000300260 A2MP01023 1474 aa27.59■■■□□ 2.01
C21orf59-202ENST00000300260 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
C21orf59-202ENST00000300260 ABCC5O15440 1437 aa27.57■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.56■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 MADDQ8WXG6 1647 aa27.56■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 DAPK1P53355 1430 aa27.55■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.55■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 PLXNC1O60486 1568 aa27.54■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.51■■■□□ 2
C21orf59-202ENST00000300260 PTPRMP28827 1452 aa27.51■■□□□ 1.99
C21orf59-202ENST00000300260 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.49■■□□□ 1.99
C21orf59-202ENST00000300260 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
C21orf59-202ENST00000300260 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.46■■□□□ 1.99
C21orf59-202ENST00000300260 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.45■■□□□ 1.99
C21orf59-202ENST00000300260 GGT6Q6P531 493 aa27.44■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 KIF3BO15066 747 aa27.42■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.42■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.982e-8■□□□□ 10.4
C21orf59-202ENST00000300260 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.4■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 KIF15Q9NS87 1388 aa27.4■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.4■■□□□ 1.98
C21orf59-202ENST00000300260 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.38■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.36■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 NCOA1Q15788 1441 aa27.35■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.35■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 PTPRKQ15262 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 ADGRL2O95490 1459 aa27.34■■□□□ 1.97
C21orf59-202ENST00000300260 ITGAEP38570 1179 aa27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms