RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272317.10

RPS27A-201, Transcript of ribosomal protein S27a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27A, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27A-201ENST00000272317 AFAP1Q8N556 730 aa26.34■■□□□ 1.81
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RPS27A-201ENST00000272317 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RPS27A-201ENST00000272317 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.32■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.32■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.3■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
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RPS27A-201ENST00000272317 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.28■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.27■■□□□ 1.8
RPS27A-201ENST00000272317 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.26■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.25■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.23■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 PREX2Q70Z35 1606 aa26.22■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS27A-201ENST00000272317 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.2■■□□□ 1.79
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RPS27A-201ENST00000272317 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.16■■□□□ 1.78
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RPS27A-201ENST00000272317 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS27A-201ENST00000272317 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.14■■□□□ 1.78
RPS27A-201ENST00000272317 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
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RPS27A-201ENST00000272317 KDM5CP41229 1560 aa26.14■■□□□ 1.78
RPS27A-201ENST00000272317 TIAM1Q13009 1591 aa26.14■■□□□ 1.78
RPS27A-201ENST00000272317 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
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RPS27A-201ENST00000272317 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.12■■□□□ 1.77
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RPS27A-201ENST00000272317 MAP3K1Q13233 1512 aa26.12■■□□□ 1.77
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RPS27A-201ENST00000272317 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.06■■□□□ 1.76
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RPS27A-201ENST00000272317 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
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RPS27A-201ENST00000272317 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.03■■□□□ 1.76
RPS27A-201ENST00000272317 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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RPS27A-201ENST00000272317 REREQ9P2R6 1566 aa25.95■■□□□ 1.75
RPS27A-201ENST00000272317 ABCA6Q8N139 1617 aa25.93■■□□□ 1.74
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RPS27A-201ENST00000272317 MIA2Q96PC5 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
RPS27A-201ENST00000272317 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.89■■□□□ 1.74
RPS27A-201ENST00000272317 ATP7AQ04656 1500 aa25.89■■□□□ 1.74
RPS27A-201ENST00000272317 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.87■■□□□ 1.73
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RPS27A-201ENST00000272317 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.6■■□□□ 1.69
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RPS27A-201ENST00000272317 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.59■■□□□ 1.69
RPS27A-201ENST00000272317 NPATQ14207 1427 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS27A-201ENST00000272317 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS27A-201ENST00000272317 KIF15Q9NS87 1388 aa25.56■■□□□ 1.68
RPS27A-201ENST00000272317 C3P01024 1663 aa25.55■■□□□ 1.68
RPS27A-201ENST00000272317 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS27A-201ENST00000272317 PTPRKQ15262 1439 aa25.53■■□□□ 1.68
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