RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269720.6

MISP3-201, Transcript of MISP family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MISP3, Length 1,424 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3-201ENST00000269720 PREX2Q70Z35 1606 aa42.39■■■■■ 4.38
MISP3-201ENST00000269720 TIAM1Q13009 1591 aa42.37■■■■■ 4.37
MISP3-201ENST00000269720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.36■■■■■ 4.37
MISP3-201ENST00000269720 RICTORQ6R327 1708 aa42.35■■■■■ 4.37
MISP3-201ENST00000269720 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
MISP3-201ENST00000269720 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.34■■■■■ 4.37
MISP3-201ENST00000269720 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.31■■■■■ 4.36
MISP3-201ENST00000269720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.31■■■■■ 4.36
MISP3-201ENST00000269720 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.29■■■■■ 4.36
MISP3-201ENST00000269720 MAP3K1Q13233 1512 aa42.28■■■■■ 4.36
MISP3-201ENST00000269720 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.27■■■■■ 4.36
MISP3-201ENST00000269720 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.24■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 ABCC1P33527 1531 aa42.21■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.21■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.21■■■■■ 4.35
MISP3-201ENST00000269720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.18■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.18■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 NCOA2Q15596 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 AFAP1Q8N556 730 aa42.17■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.13■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.13■■■■■ 4.34
MISP3-201ENST00000269720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.13■■■■■ 4.33
MISP3-201ENST00000269720 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.12■■■■■ 4.33
MISP3-201ENST00000269720 APLP2Q06481 763 aa42.12■■■■■ 4.33
MISP3-201ENST00000269720 KDM5CP41229 1560 aa42.11■■■■■ 4.33
MISP3-201ENST00000269720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.06■■■■■ 4.32
MISP3-201ENST00000269720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.06■■■■■ 4.32
MISP3-201ENST00000269720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.05■■■■■ 4.32
MISP3-201ENST00000269720 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.03■■■■■ 4.32
MISP3-201ENST00000269720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
MISP3-201ENST00000269720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 MLH3Q9UHC1 1453 aa42■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.97■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 ATP10AO60312 1499 aa41.97■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.95■■■■■ 4.31
MISP3-201ENST00000269720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.91■■■■■ 4.3
MISP3-201ENST00000269720 MBD5Q9P267 1494 aa41.89■■■■■ 4.3
MISP3-201ENST00000269720 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.85■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.84■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.84■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.84■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.82■■■■■ 4.29
MISP3-201ENST00000269720 ABCA6Q8N139 1617 aa41.81■■■■■ 4.28
MISP3-201ENST00000269720 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.8■■■■■ 4.28
MISP3-201ENST00000269720 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.8■■■■■ 4.28
MISP3-201ENST00000269720 MIA2Q96PC5 1412 aa41.79■■■■■ 4.28
MISP3-201ENST00000269720 REREQ9P2R6 1566 aa41.76■■■■■ 4.28
MISP3-201ENST00000269720 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.75■■■■■ 4.27
MISP3-201ENST00000269720 ATP7AQ04656 1500 aa41.73■■■■■ 4.27
MISP3-201ENST00000269720 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
MISP3-201ENST00000269720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.71■■■■■ 4.27
MISP3-201ENST00000269720 MLECQ14165 292 aa41.69■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.67■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 MADDQ8WXG6 1647 aa41.67■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.65■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 AGLP35573 1532 aa41.64■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 PTPRMP28827 1452 aa41.64■■■■■ 4.26
MISP3-201ENST00000269720 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.58■■■■■ 4.25
MISP3-201ENST00000269720 TSPY4P0CV99 314 aa41.56■■■■■ 4.24
MISP3-201ENST00000269720 TSPY10P0CW01 314 aa41.56■■■■■ 4.24
MISP3-201ENST00000269720 A2MP01023 1474 aa41.56■■■■■ 4.24
MISP3-201ENST00000269720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.52■■■■■ 4.24
MISP3-201ENST00000269720 PLXNC1O60486 1568 aa41.51■■■■■ 4.24
MISP3-201ENST00000269720 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
MISP3-201ENST00000269720 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
MISP3-201ENST00000269720 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.46■■■■■ 4.23
MISP3-201ENST00000269720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
MISP3-201ENST00000269720 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.44■■■■■ 4.22
MISP3-201ENST00000269720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.42■■■■■ 4.22
MISP3-201ENST00000269720 ABCC5O15440 1437 aa41.4■■■■■ 4.22
MISP3-201ENST00000269720 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
MISP3-201ENST00000269720 DAPK1P53355 1430 aa41.35■■■■■ 4.21
MISP3-201ENST00000269720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.33■■■■■ 4.21
MISP3-201ENST00000269720 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.33■■■■■ 4.21
MISP3-201ENST00000269720 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MISP3-201ENST00000269720 GGT6Q6P531 493 aa41.3■■■■■ 4.2
MISP3-201ENST00000269720 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
MISP3-201ENST00000269720 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.28■■■■■ 4.2
MISP3-201ENST00000269720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
MISP3-201ENST00000269720 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
MISP3-201ENST00000269720 KIF3BO15066 747 aa41.26■■■■■ 4.19
MISP3-201ENST00000269720 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.25■■■■■ 4.19
MISP3-201ENST00000269720 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.25■■■■■ 4.19
MISP3-201ENST00000269720 KIF15Q9NS87 1388 aa41.17■■■■■ 4.18
MISP3-201ENST00000269720 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.16■■■■■ 4.18
MISP3-201ENST00000269720 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.16■■■■■ 4.18
MISP3-201ENST00000269720 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.15■■■■■ 4.18
MISP3-201ENST00000269720 ZMYM3Q14202 1370 aa41.13■■■■■ 4.18
MISP3-201ENST00000269720 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.12■■■■■ 4.17
MISP3-201ENST00000269720 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.11■■■■■ 4.17
MISP3-201ENST00000269720 C3P01024 1663 aa41.1■■■■■ 4.17
MISP3-201ENST00000269720 MROH2AA6NES4 1674 aa41.1■■■■■ 4.17
MISP3-201ENST00000269720 NCOA1Q15788 1441 aa41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms