RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.98■■□□□ 1.27
COL5A3-201ENST00000264828 SMARCA2P51531 1590 aa22.97■■□□□ 1.27
COL5A3-201ENST00000264828 SOX12O15370 315 aa22.96■■□□□ 1.27
COL5A3-201ENST00000264828 GOLGA2Q08379 1002 aa22.94■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 APBB1O00213 710 aa22.94■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 MCCP23508 829 aa22.93■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.92■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 CLSTN1O94985 981 aa22.91■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 TMF1P82094 1093 aa22.91■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 KANK1Q14678 1352 aa22.9■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
COL5A3-201ENST00000264828 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.87■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 WIZO95785 1651 aa22.85■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 MORC1Q86VD1 984 aa22.84■■□□□ 1.25
COL5A3-201ENST00000264828 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 MLECQ14165 292 aa22.81■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 CCER2I3L3R5 266 aa22.78■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 GBP4Q96PP9 640 aa22.77■■□□□ 1.24
COL5A3-201ENST00000264828 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.76■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.75■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.73■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.73■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.73■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD1Q16676 465 aa22.72■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.72■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
COL5A3-201ENST00000264828 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.7■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.69■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 STK26Q9P289 416 aa22.69■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 CFAP44Q96MT7 982 aa22.68■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 PTMSP20962 102 aa22.66■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.66■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.65■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
COL5A3-201ENST00000264828 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 GGT6Q6P531 493 aa22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 FMN1Q68DA7 1419 aa22.61■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 PKD2Q13563 968 aa22.6■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
COL5A3-201ENST00000264828 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 PDE4CQ08493 712 aa22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 TPM4P67936 248 aa22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 SMARCA4P51532 1647 aa22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.54■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.53■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.53■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.52■■□□□ 1.2
COL5A3-201ENST00000264828 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.51■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.51■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 RALBP1Q15311 655 aa22.51■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.5■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.5■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.49■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.47■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 NUP155O75694 1391 aa22.47■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 GORABQ5T7V8 394 aa22.47■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.46■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.45■■□□□ 1.19
COL5A3-201ENST00000264828 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.45■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.45■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 GPATCH3Q96I76 525 aa22.44■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 STK31Q9BXU1 1019 aa22.44■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 SLC4A3P48751 1232 aa22.42■■□□□ 1.18
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