RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.85■■■■□ 3.97
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TOMM40-201ENST00000252487 GLI2P10070 1586 aa39.84■■■■□ 3.97
TOMM40-201ENST00000252487 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.82■■■■□ 3.97
TOMM40-201ENST00000252487 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.82■■■■□ 3.96
TOMM40-201ENST00000252487 CD109Q6YHK3 1445 aa39.8■■■■□ 3.96
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TOMM40-201ENST00000252487 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.32■■■■□ 3.88
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TOMM40-201ENST00000252487 TSPY10P0CW01 314 aa39.27■■■■□ 3.88
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TOMM40-201ENST00000252487 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.17■■■■□ 3.86
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TOMM40-201ENST00000252487 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
TOMM40-201ENST00000252487 HFM1A2PYH4 1435 aa39.15■■■■□ 3.86
TOMM40-201ENST00000252487 NAIPQ13075 1403 aa39.15■■■■□ 3.86
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TOMM40-201ENST00000252487 ATP10AO60312 1499 aa38.72■■■■□ 3.79
TOMM40-201ENST00000252487 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.68■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 KIF3BO15066 747 aa38.67■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 UNC13BO14795 1591 aa38.66■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-201ENST00000252487 DEPDC5O75140 1603 aa38.6■■■■□ 3.77
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