RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.43■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 MIA2Q96PC5 1412 aa22.42■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 MRS2Q9HD23 443 aa22.41■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.41■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.39■■□□□ 1.18
LRP11-201ENST00000239367 IL27Q8NEV9 243 aa22.37■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.36■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.35■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 KDM6BO15054 1643 aa22.34■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 NCOA1Q15788 1441 aa22.34■■□□□ 1.17
LRP11-201ENST00000239367 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 IQGAP2Q13576 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 ROCK1Q13464 1354 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 CCDC7Q96M83 1385 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LRP11-201ENST00000239367 WDR62O43379 1518 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 PBRM1Q86U86 1689 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 DAPK1P53355 1430 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.21■■□□□ 1.15
LRP11-201ENST00000239367 FOXD1Q16676 465 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 ADAMTS12P58397 1594 aa22.19■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.17■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 ABCC5O15440 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 ARID3CA6NKF2 412 aa22.16■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 NEFMP07197 916 aa22.15■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.14■■□□□ 1.14
LRP11-201ENST00000239367 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRP11-201ENST00000239367 KIAA0556O60303 1618 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 MBD5Q9P267 1494 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 PZPP20742 1482 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 DISP1Q96F81 1524 aa22.03■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.02■■□□□ 1.12
LRP11-201ENST00000239367 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 SKAP1Q86WV1 359 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 SLC4A3P48751 1232 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 ADGRL2O95490 1459 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.97■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 KIF14Q15058 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 USP47Q96K76 1375 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
LRP11-201ENST00000239367 NUDCQ9Y266 331 aa21.94■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 IFT140Q96RY7 1462 aa21.93■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 KDM5CP41229 1560 aa21.92■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 TMC1Q8TDI8 760 aa21.92■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP11-201ENST00000239367 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.89■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 GRIN2AQ12879 1464 aa21.87■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 PKD2Q13563 968 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.84■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 PDE4AP27815 886 aa21.83■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 ARXQ96QS3 562 aa21.83■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.83■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LRP11-201ENST00000239367 KIF15Q9NS87 1388 aa21.81■■□□□ 1.08
LRP11-201ENST00000239367 PLIN1O60240 522 aa21.81■■□□□ 1.08
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