RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235349.5

PRAMEF4-201, Transcript of PRAME family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF4, Length 1,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4-201ENST00000235349 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 PREX2Q70Z35 1606 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ABCC5O15440 1437 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 PLCH2O75038 1416 aa15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 DAPK1P53355 1430 aa15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 MAPKBP1O60336 1514 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 MBD5Q9P267 1494 aa15.07■□□□□ 0
PRAMEF4-201ENST00000235349 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.06■□□□□ 0
PRAMEF4-201ENST00000235349 NAIPQ13075 1403 aa15.05■□□□□ 0
PRAMEF4-201ENST00000235349 AKNAQ7Z591 1439 aa15.05■□□□□ 0
PRAMEF4-201ENST00000235349 CD109Q6YHK3 1445 aa15.05■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.04■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 HFM1A2PYH4 1435 aa15.04■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.04■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.02■□□□□ -0
PRAMEF4-201ENST00000235349 FANCAO15360 1455 aa15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 KDM6BO15054 1643 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 TSPY4P0CV99 314 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 TSPY10P0CW01 314 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ROCK1Q13464 1354 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 NCOA1Q15788 1441 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 RSPH4AQ5TD94 716 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ABCC1P33527 1531 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 AFAP1Q8N556 730 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 GLI2P10070 1586 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 DIP2BQ9P265 1576 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 TSPOAP1O95153 1857 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ADGRL2O95490 1459 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF4-201ENST00000235349 ADGRL1O94910 1474 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRIM52Q96A61 297 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 KIF15Q9NS87 1388 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF4-201ENST00000235349 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 RAPGEF3O95398 923 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 NEO1Q92859 1461 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 PLXNC1O60486 1568 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF4-201ENST00000235349 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 ATP7AQ04656 1500 aa14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 RICTORQ6R327 1708 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 FOXD1Q16676 465 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 KDM5CP41229 1560 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 PZPP20742 1482 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 NUP155O75694 1391 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 NEUROD1Q13562 356 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF4-201ENST00000235349 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF4-201ENST00000235349 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF4-201ENST00000235349 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms