RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 PREX2Q70Z35 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
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CBX1-201ENST00000225603 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.58■■□□□ 1.85
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CBX1-201ENST00000225603 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CBX1-201ENST00000225603 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CBX1-201ENST00000225603 ABCA6Q8N139 1617 aa26.4■■□□□ 1.82
CBX1-201ENST00000225603 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.39■■□□□ 1.82
CBX1-201ENST00000225603 FOXD1Q16676 465 aa26.39■■□□□ 1.82
CBX1-201ENST00000225603 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.811e-7■■□□□ 14.1
CBX1-201ENST00000225603 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.38■■□□□ 1.81
CBX1-201ENST00000225603 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.37■■□□□ 1.81
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