RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
NME3-201ENST00000219302 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NME3-201ENST00000219302 HECW1Q76N89 1606 aa26.07■■□□□ 1.76
NME3-201ENST00000219302 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.06■■□□□ 1.76
NME3-201ENST00000219302 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NME3-201ENST00000219302 FBXO41Q8TF61 875 aa26.04■■□□□ 1.76
NME3-201ENST00000219302 MLECQ14165 292 aa26.01■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 ATP10AO60312 1499 aa25.99■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 KIF14Q15058 1648 aa25.97■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 HSPA2P54652 639 aa25.97■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.97■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.97■■□□□ 1.75
NME3-201ENST00000219302 AFAP1Q8N556 730 aa25.95■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.93■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 CLIP1P30622 1438 aa25.92■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.91■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.91■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.91■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.89■■□□□ 1.74
NME3-201ENST00000219302 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.87■■□□□ 1.73
NME3-201ENST00000219302 KDM5CP41229 1560 aa25.87■■□□□ 1.73
NME3-201ENST00000219302 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.86■■□□□ 1.73
NME3-201ENST00000219302 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NME3-201ENST00000219302 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.83■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.81■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.8■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.8■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.79■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.78■■□□□ 1.72
NME3-201ENST00000219302 REREQ9P2R6 1566 aa25.76■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 PREX2Q70Z35 1606 aa25.74■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 ABCC1P33527 1531 aa25.73■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 CERKQ8TCT0 537 aa25.73■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 ABCA6Q8N139 1617 aa25.72■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 AGLP35573 1532 aa25.71■■□□□ 1.71
NME3-201ENST00000219302 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.7■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.67■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.67■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.65■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.64■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
NME3-201ENST00000219302 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.63■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 STRCQ7RTU9 1775 aa25.61■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 C3P01024 1663 aa25.6■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.6■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
NME3-201ENST00000219302 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.56■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.56■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.55■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.52■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 PTPRTO14522 1441 aa25.52■■□□□ 1.68
NME3-201ENST00000219302 ZMYM3Q14202 1370 aa25.5■■□□□ 1.67
NME3-201ENST00000219302 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.5■■□□□ 1.67
NME3-201ENST00000219302 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.48■■□□□ 1.67
NME3-201ENST00000219302 ATP7AQ04656 1500 aa25.47■■□□□ 1.67
NME3-201ENST00000219302 NPATQ14207 1427 aa25.46■■□□□ 1.67
NME3-201ENST00000219302 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 A2MP01023 1474 aa25.45■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 NCOA1Q15788 1441 aa25.44■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 MROH2AA6NES4 1674 aa25.43■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 PLXNC1O60486 1568 aa25.43■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 MBD5Q9P267 1494 aa25.4■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 GGT6Q6P531 493 aa25.4■■□□□ 1.66
NME3-201ENST00000219302 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.38■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.37■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 TIAM1Q13009 1591 aa25.37■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 CEP162Q5TB80 1403 aa25.37■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 PTPRKQ15262 1439 aa25.36■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.35■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.34■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.34■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.34■■□□□ 1.65
NME3-201ENST00000219302 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
NME3-201ENST00000219302 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.29■■□□□ 1.64
NME3-201ENST00000219302 PKD2Q13563 968 aa25.28■■□□□ 1.64
NME3-201ENST00000219302 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.27■■□□□ 1.64
NME3-201ENST00000219302 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.26■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 PLA2R1Q13018 1463 aa25.26■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.24■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 NCOA2Q15596 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 KIF3BO15066 747 aa25.22■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.21■■□□□ 1.63
NME3-201ENST00000219302 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NME3-201ENST00000219302 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.19■■□□□ 1.62
NME3-201ENST00000219302 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-201ENST00000219302 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
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