RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.55■■□□□ 1.84
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USP18-201ENST00000215794 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
USP18-201ENST00000215794 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.5■■□□□ 1.83
USP18-201ENST00000215794 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
USP18-201ENST00000215794 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.47■■□□□ 1.83
USP18-201ENST00000215794 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.47■■□□□ 1.83
USP18-201ENST00000215794 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.44■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 PREX2Q70Z35 1606 aa26.44■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.43■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.42■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 HFM1A2PYH4 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 MIA2Q96PC5 1412 aa26.41■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
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USP18-201ENST00000215794 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.39■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
USP18-201ENST00000215794 DIP2BQ9P265 1576 aa26.37■■□□□ 1.81
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USP18-201ENST00000215794 PLCH2O75038 1416 aa26.37■■□□□ 1.81
USP18-201ENST00000215794 NAIPQ13075 1403 aa26.36■■□□□ 1.81
USP18-201ENST00000215794 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.35■■□□□ 1.81
USP18-201ENST00000215794 CD109Q6YHK3 1445 aa26.34■■□□□ 1.81
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USP18-201ENST00000215794 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.82e-8■■■■■ 29.6
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USP18-201ENST00000215794 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.29■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 FANCAO15360 1455 aa26.28■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.27■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.27■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 MIER1Q8N108 512 aa26.27■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.27■■□□□ 1.8
USP18-201ENST00000215794 GLI2P10070 1586 aa26.26■■□□□ 1.79
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
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USP18-201ENST00000215794 DAPK1P53355 1430 aa26.24■■□□□ 1.79
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USP18-201ENST00000215794 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.22■■□□□ 1.79
USP18-201ENST00000215794 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.21■■□□□ 1.79
USP18-201ENST00000215794 MBD5Q9P267 1494 aa26.21■■□□□ 1.79
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USP18-201ENST00000215794 ABCC1P33527 1531 aa26.2■■□□□ 1.78
USP18-201ENST00000215794 KDM6BO15054 1643 aa26.19■■□□□ 1.78
USP18-201ENST00000215794 AKNAQ7Z591 1439 aa26.17■■□□□ 1.78
USP18-201ENST00000215794 ADGRL1O94910 1474 aa26.17■■□□□ 1.78
USP18-201ENST00000215794 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
USP18-201ENST00000215794 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.16■■□□□ 1.78
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USP18-201ENST00000215794 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.14■■□□□ 1.77
USP18-201ENST00000215794 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.12■■□□□ 1.77
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USP18-201ENST00000215794 TSPY10P0CW01 314 aa26.07■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 RAPGEF3O95398 923 aa26.06■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 NEO1Q92859 1461 aa26.06■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 TRIM52Q96A61 297 aa26.05■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
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USP18-201ENST00000215794 TONSLQ96HA7 1378 aa26.03■■□□□ 1.76
USP18-201ENST00000215794 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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USP18-201ENST00000215794 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.01■■□□□ 1.75
USP18-201ENST00000215794 NCOA1Q15788 1441 aa26■■□□□ 1.75
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USP18-201ENST00000215794 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.99■■□□□ 1.75
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USP18-201ENST00000215794 ATP7AQ04656 1500 aa25.91■■□□□ 1.74
USP18-201ENST00000215794 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
USP18-201ENST00000215794 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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USP18-201ENST00000215794 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.89■■□□□ 1.73
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USP18-201ENST00000215794 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.85■■□□□ 1.73
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