RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 MecomP14404 1042 aa21.03■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 Adam1bQ8R534 806 aa21.02■□□□□ 0.96
Shq1-202ENSMUST00000113312 Paf1Q8K2T8 535 aa21.01■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Txndc2Q6P902 515 aa21■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 BccipQ9CWI3 316 aa21■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnai2A2AC93 623 aa21■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pak3Q61036 559 aa21■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.99■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mtus2Q3UHD3 1353 aa20.98■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa20.96■□□□□ 0.95
Shq1-202ENSMUST00000113312 Brpf1B2RRD7 1212 aa20.95■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppm1gQ61074 542 aa20.92■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cluap1Q8R3P7 413 aa20.92■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zfp777B9EKF4 885 aa20.92■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa20.91■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm973E9Q295 1059 aa20.9■□□□□ 0.94
Shq1-202ENSMUST00000113312 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 HdgfP51859 237 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Bcl11bQ99PV8 884 aa20.87■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ripply1Q2WG77 201 aa20.86■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gpatch11Q3UFS4 262 aa20.86■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.86■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cep164Q5DU05 1446 aa20.85■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.83■□□□□ 0.93
Shq1-202ENSMUST00000113312 GorabQ8BRM2 368 aa20.83■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 AknaQ80VW7 1404 aa20.82■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpd52l1O54818 204 aa20.81■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 AcrbpQ3V140 540 aa20.81■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tnnt2P50752 301 aa20.8■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Calcoco2A2A6M5 331 aa20.8■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa20.79■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa20.79■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa20.77■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa20.77■□□□□ 0.92
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc27Q3V036 639 aa20.75■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.75■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 AppP12023 770 aa20.74■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rundc1Q0VDN7 615 aa20.74■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dcaf11Q91VU6 549 aa20.73■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krt82Q99M74 516 aa20.73■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.72■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 R3hcc1Q8BSI6 488 aa20.72■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Znf704Q9ERQ3 566 aa20.72■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccer1Q9CQL2 403 aa20.7■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.91
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Samd1D3YXK1 519 aa20.7■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 MsnP26041 577 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa20.7■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fhad1A6PWD2 1420 aa20.69■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Wdr78E9PYY5 807 aa20.69■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Klf15Q9EPW2 415 aa20.69■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20.68■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc96Q9CR92 584 aa20.67■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ap3b2Q9JME5 1082 aa20.65■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pde3bQ61409 1100 aa20.64■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pip4k2bQ80XI4 416 aa20.64■□□□□ 0.9
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm21969J3QJZ1 289 aa20.64■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Drc7Q6V3W6 876 aa20.64■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Golga2Q921M4 999 aa20.63■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 AU015836B2RUM3 263 aa20.63■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tmf1B9EKI3 1091 aa20.62■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa20.6■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sytl4Q9R0Q1 673 aa20.6■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Eea1Q8BL66 1411 aa20.6■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpm4Q6IRU2 248 aa20.6■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Supt16hQ920B9 1047 aa20.6■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ksr2Q3UVC0 959 aa20.59■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 IbspQ61711 324 aa20.59■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 CrbnQ8C7D2 445 aa20.59■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc146E9Q9F7 977 aa20.58■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 RdxP26043 583 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cabp4Q8VHC5 271 aa20.58■□□□□ 0.89
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chmp5Q9D7S9 219 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.4 ms