RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ScribQ80U72 1612 aa16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 NudcO35685 332 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rwdd1Q9CQK7 243 aa16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccnb3Q810T2 1396 aa16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zscan21Q07231 555 aa16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dcaf11Q91VU6 549 aa16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plcb2A3KGF7 1181 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Birc3O08863 600 aa16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Plekhh2Q8C115 1491 aa16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Txndc2Q6P902 515 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ppm1gQ61074 542 aa16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trim44Q9QXA7 346 aa16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rock2P70336 1388 aa16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Psme1P97371 249 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sox12Q04890 314 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc4a1apE9PX68 744 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmco5bQ80X59 307 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Supt16hQ920B9 1047 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp777B9EKF4 885 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Chmp5Q9D7S9 219 aa16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Map7O88735 730 aa16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Golga2Q921M4 999 aa16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 WrnO09053 1401 aa16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CrbnQ8C7D2 445 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Htatsf1Q8BGC0 757 aa16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PtmaP26350 111 aa16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spryd3E9Q9B3 442 aa16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf330Q922H9 316 aa16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Lmod3E9QA62 571 aa16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Usp47Q8BY87 1376 aa16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cluap1Q8R3P7 413 aa16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc27Q3V036 639 aa16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tnnt1O88346 262 aa16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clstn1Q9EPL2 979 aa16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 UacaQ8CGB3 1411 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CatipB9EKE5 520 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf326O88291 580 aa16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tdrd9Q14BI7 1383 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pank3Q8R2W9 370 aa16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q3TQI7 289 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pibf1E9Q6K3 756 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ksr2Q3UVC0 959 aa16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Jph4Q80WT0 628 aa16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Inpp5dQ9ES52 1191 aa16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 EspnQ9ET47 871 aa16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ggt6Q6PDE7 497 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sh3bp5Q9Z131 463 aa16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Usp40Q8BWR4 1235 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Soga1E1U8D0 1418 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tsen2Q6P7W5 460 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 CenpjQ569L8 1344 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Stard8Q8K031 1019 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Shq1Q7TMX5 569 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Casc1Q6TDU8 730 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dnai1Q8C0M8 701 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rassf8Q8CJ96 419 aa16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rad54l2Q99NG0 1466 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp644E9QA22 1323 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 MccE9PWI3 1003 aa16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mink1Q9JM52 1308 aa16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PnnO35691 725 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam184bQ0KK56 942 aa16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Q8BT18 775 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.6 ms