RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025421.7

Seh1l-201, Transcript of Nucleoporin SEH1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Seh1l, Length 3,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.51■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.51■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rundc1Q0VDN7 615 aa22.51■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ncoa3O09000 1398 aa22.5■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Exoc6Q8R313 802 aa22.49■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ecm2Q5FW85 670 aa22.49■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.49■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa22.48■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.48■■□□□ 1.19
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.47■■□□□ 1.19
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Erich3F6QRE9 1637 aa22.45■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Card11Q8CIS0 1159 aa22.45■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.42■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Calr4Q3TQS0 420 aa22.42■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abcc5Q9R1X5 1436 aa22.41■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Jph4Q80WT0 628 aa22.4■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mug1P28665 1476 aa22.4■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc4a3P16283 1227 aa22.37■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.37■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ift140E9PY46 1464 aa22.35■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa22.34■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Znf710Q3U288 666 aa22.34■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Neo1P97798 1493 aa22.33■■□□□ 1.17
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.33■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 UacaQ8CGB3 1411 aa22.33■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa22.32■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Stk24Q99KH8 431 aa22.32■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ncoa2Q61026 1462 aa22.29■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Soga1E1U8D0 1418 aa22.27■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Map3k5O35099 1380 aa22.27■■□□□ 1.16
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa22.27■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Anp32aO35381 247 aa22.26■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa22.26■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.25■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cnga1P29974 684 aa22.24■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.24■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Naip5Q9R016 1403 aa22.24■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa22.2■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.18■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dapk1Q80YE7 1442 aa22.17■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa22.16■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.16■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kif3bQ61771 747 aa22.16■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Prex2Q3LAC4 1598 aa22.15■■□□□ 1.14
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Sall3Q62255 1320 aa22.13■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.12■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.1■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa22.09■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kcnh8P59111 1102 aa22.09■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abca5Q8K448 1642 aa22.09■■□□□ 1.13
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Trappc8E9PWG2 1437 aa22.07■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa22.06■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q7TT23 1179 aa22.05■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Inpp5dQ9ES52 1191 aa22.03■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Clstn2Q9ER65 966 aa22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Adcy10Q8C0T9 1614 aa22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abca16E9PWJ7 1678 aa22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Adamts12Q811B3 1600 aa22.02■■□□□ 1.12
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Neurod2Q62414 383 aa22.01■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm20521D3Z5F7 333 aa22.01■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Arhgap5P97393 1501 aa22.01■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Peg3Q3URU2 1571 aa22■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Polr3glQ8R0C0 218 aa22■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa21.99■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fan1Q69ZT1 1020 aa21.99■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fam163aQ8CAA5 168 aa21.99■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pank3Q8R2W9 370 aa21.98■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.98■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.98■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc4a1apE9PX68 744 aa21.98■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.97■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm13695A2AK44 830 aa21.97■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.96■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Trim26Q99PN3 545 aa21.96■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Washc2Q6PGL7 1334 aa21.96■■□□□ 1.11
Seh1l-201ENSMUST00000025421 SphkapQ6NSW3 1687 aa21.95■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Stk26Q99JT2 416 aa21.94■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abcc2Q8VI47 1543 aa21.93■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Setd1bQ8CFT2 1985 aa21.93■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm14025A2AP89 1413 aa21.92■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Il16O54824 1322 aa21.92■■□□□ 1.1
Seh1l-201ENSMUST00000025421 CrbnQ8C7D2 445 aa21.91■■□□□ 1.1
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