RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	MPS1	P54199	764 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR042W	YNR042W	NGL3	Q03210	505 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNR042W	YNR042W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNR042W	YNR042W	CCW14	O13547	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	NUP1	P20676	1076 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MEF1	P25039	761 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YMC1	P32331	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TUL1	P36096	758 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YBR062C	P38239	180 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ICE2	P40499	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MNT3	P40549	630 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PXA1	P41909	870 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SNO3	P43544	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RAD17	P48581	401 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	KXD1	P53158	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ATG16	Q03818	150 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	REX3	Q12090	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	HOS1	Q12214	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YCR099C	P25657	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	APT2	P36973	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MRP21	P38175	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ALG3	P38179	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
YNR042W	YNR042W	FET3	P38993	636 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GAT2	P40209	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PRM2	P40534	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ALY2	P47029	1046 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SPT20	P50875	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MPS2	P53159	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BOP2	Q06150	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ISU2	Q12056	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GLO4	Q12320	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GEP5	Q12393	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PHO5	P00635	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ERG8	P24521	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ZIP1	P31111	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GUT2	P32191	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CKB2	P38930	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	NDE1	P40215	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ARG2	P40360	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MAL11	P53048	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	JJJ1	P53863	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	UPC2	Q12151	913 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	FLO9	P39712	1322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	BEM3	P32873	1128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	TOM20	P35180	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	OAR1	P35731	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YJL206C	P39529	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SPC72	P39723	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	VRG4	P40107	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YJR149W	P47177	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YML6	P51998	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	YGR015C	P53208	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	VPS16	Q03308	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
YNR042W	YNR042W	MCH5	Q08777	521 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	MLH3	Q12083	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	COR1	P07256	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	PCT1	P13259	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	OMA1	P36163	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	IFA38	P38286	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	HIS2	P38635	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	DMA1	P38823	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	FRT2	P39734	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNR042W	YNR042W	NEO1	P40527	1151 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.6 ms