RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 C8orf37Q96NL8 207 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NUP58Q9BVL2 599 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NRAPQ86VF7 1730 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RHOBTB3O94955 611 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 GLI1P08151 1106 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 KCNB1Q14721 858 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 C8orf74Q6P047 294 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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PMS1-222ENST00000639501 H0YHG0 523 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 KIF11P52732 1056 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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PMS1-222ENST00000639501 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RETREG2Q8NC44 543 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CD248Q9HCU0 757 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NFU1Q9UMS0 254 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 KIAA0754O94854 1291 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CYP7A1P22680 504 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TRAPPC10P48553 1259 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 SEC24CP53992 1094 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CCDC181Q5TID7 509 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.77■■□□□ 1.24
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PMS1-222ENST00000639501 SCG2P13521 617 aa22.77■■□□□ 1.24
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PMS1-222ENST00000639501 CDK17Q00537 523 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PRLRP16471 622 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF8P28908 595 aa22.76■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 IQCKQ8N0W5 287 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 NGLY1Q96IV0 654 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 TLR10Q9BXR5 811 aa22.76■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.76■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 EPN3Q9H201 632 aa22.76■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 SLIT2O94813 1529 aa22.76■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 A0A1W2PQJ5 194 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ZPR1O75312 459 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 FCER1AP12319 257 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PSEN1P49768 467 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 STK4Q13043 487 aa22.75■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 TRADDQ15628 312 aa22.75■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.75■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 GUCY2FP51841 1108 aa22.74■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 TMC4Q7Z404 712 aa22.74■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 NR1D1P20393 614 aa22.73■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 ATP6V1AP38606 617 aa22.73■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 FIGNQ5HY92 759 aa22.73■■□□□ 1.23
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PMS1-222ENST00000639501 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R37O75864 691 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 DDAH1O94760 285 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 ATP2B2Q01814 1243 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PMS1-222ENST00000639501 GDF3Q9NR23 364 aa22.73■■□□□ 1.23
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