RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	DIO2	Q92813	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NRDC	O43847	1150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MSC	O60682	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	EFEMP2	O95967	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CHRNE	Q04844	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175		Q8N1Y9	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	C7orf72	A4D263	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	EFCAB14	O75071	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LCP1	P13796	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	HK2	P52789	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CORO7	P57737	925 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GPR85	P60893	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NINJ1	Q92982	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SCLY	Q96I15	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	AQP7	O14520	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NPHS1	O60500	1241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GYS2	P54840	703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RTP1	P59025	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ERVFC1	P60507	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	OXR1	Q8N573	874 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	DPF3	Q92784	378 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ARVCF	O00192	962 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	WNT9A	O14904	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	CLSTN1	O94985	981 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	SDS	P20132	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	GTF2A2	P52657	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	MVK	Q03426	396 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATRX-223	ENST00000637175	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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