RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIN3B	O60391	1043 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ATE1	O95260	518 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FURIN	P09958	794 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE4B	Q07343	736 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR78	Q5VTH9	848 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PCGF5	Q86SE9	256 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PASD1	Q8IV76	773 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MTA3	Q9BTC8	594 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPOAP1	O95153	1857 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM5C	P41229	1560 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	HMX2	A2RU54	273 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX3	O15119	743 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR39	O43194	453 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SUSD5	O60279	629 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RFPL1	O75677	317 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PGR	P06401	933 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CPE	P16870	476 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ERAP2	Q6P179	960 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	VHLL	Q6RSH7	139 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	AFAP1	Q8N556	730 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GPATCH11	Q8N954	259 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TM9SF2	Q99805	663 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FBRS	Q9HAH7	460 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LGR6	Q9HBX8	967 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ROCK1	Q13464	1354 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC5	O15440	1437 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		6.23	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRD	O14764	452 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ABLIM3	O94929	683 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCG1	P19174	1290 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	STAT4	Q14765	748 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	HID1	Q8IV36	788 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	OBP2A	Q9NY56	170 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DAPK1	P53355	1430 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RICTOR	Q6R327	1708 aa		6.22	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR3B	O95264	441 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM27	P14373	513 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NEK3	P51956	506 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NCAPH	Q15003	741 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	IL31	Q6EBC2	164 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TIFA	Q96CG3	184 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	EPN3	Q9H201	632 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.21	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		6.21	□□□□□ -1.41

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