RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627968.2

HIVEP1-209, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 8,924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-209ENST00000627968 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.13□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 RRAGCQ9HB90 399 aa13.13□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L15C9J2P7 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L11C9JVI0 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L18D6R9N7 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L22D6RA61 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L19D6RCP7 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L20D6RJB6 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 OATP04181 439 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L24Q0WX57 530 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 USP17L6PQ6QN14 398 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PTPRMP28827 1452 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CASC4Q6P4E1 433 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 BANK1Q8NDB2 785 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CBX8Q9HC52 389 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 RNF146Q9NTX7 359 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ABCB11O95342 1321 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ATP6V0A1Q93050 837 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 RMDN3Q96TC7 470 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 BCRP11274 1271 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MTMR2Q13614 643 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ADAM9Q13443 819 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PKP1Q13835 747 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CEP95Q96GE4 821 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 KCNK9Q9NPC2 374 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ATL3Q6DD88 541 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 STIM2Q9P246 746 aa13.12□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MCM3P25205 808 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 FOXO4P98177 505 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MTX1Q13505 466 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CAVIN2O95810 425 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 HOXD10P28358 340 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 GEN1Q17RS7 908 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 THNSL1Q8IYQ7 743 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CAMTA2O94983 1202 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MCM6Q14566 821 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ATP2A1O14983 1001 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 KCNA4P22459 653 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 HESX1Q9UBX0 185 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 NEDD4P46934 1319 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SNX16P57768 344 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.11□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PPP1R2P41236 205 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MAGEA1P43355 309 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 TNNC1P63316 161 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CCDC125Q86Z20 511 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 AKR1B1P15121 316 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 UPP2O95045 317 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 LLGL1Q15334 1064 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 PTCH1Q13635 1447 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MYBP10242 640 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 ADKP55263 362 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 STXBP2Q15833 593 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 MLKLQ8NB16 471 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SLC4A1P02730 911 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 METTL23Q86XA0 190 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 F5H6K3 240 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 CD58P19256 250 aa13.1□□□□□ -0.31
HIVEP1-209ENST00000627968 KLRC3Q07444 240 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms