RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PMS1-220	ENST00000618056	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PMS1-220	ENST00000618056	KBTBD13	C9JR72	458 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PMS1-220	ENST00000618056	GNAQ	P50148	359 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PMS1-220	ENST00000618056	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PMS1-220	ENST00000618056	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	EVI5	O60447	810 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	GHRHR	Q02643	423 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	RNF180	Q86T96	592 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	VTA1	Q9NP79	307 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	ADCY6	O43306	1168 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	ADAMTS4	O75173	837 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	OPLAH	O14841	1288 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	PGK1	P00558	417 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	EDNRB	P24530	442 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056		H0YGN5	161 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	APOA5	Q6Q788	366 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	RXRA	P19793	462 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	PHF24	Q9UPV7	400 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056		B4DLN1	442 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	HSD17B4	P51659	736 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	COL20A1	Q9P218	1284 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	GJA9	P57773	515 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	NKX3-2	P78367	333 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	TNFAIP2	Q03169	654 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PMS1-220	ENST00000618056	PSMA5	P28066	241 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RCAN1	P53805	252 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	PDE4D	Q08499	809 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	FBXL16	Q8N461	479 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	SPC25	Q9HBM1	224 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CFB	P00751	764 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CPA1	P15085	419 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RMDN3	Q96TC7	470 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	ZBTB43	O43298	467 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	SMPD1	P17405	629 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	RPS6KB1	P23443	525 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056		Q9Y3F1	56 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	FGD1	P98174	961 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	SNX17	Q15036	470 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056		Q6ZUG5	572 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	MYADML2	A6NDP7	307 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CTAGE5	O15320	804 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PMS1-220	ENST00000618056	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.78	■■■□□ 2.2

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