RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ASTN1O14525 1302 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SNHG28P0DPA3 235 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 MCM5P33992 734 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGSQ96S52 555 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0C4DFX4 3053 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 CYTH3O43739 400 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A27O95847 323 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 GJB1P08034 283 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 TROAPQ12815 778 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 RBSNQ9H1K0 784 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-209ENST00000607882 RPTORQ8N122 1335 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 STRNO43815 780 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SGPL1O95470 568 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PGK1P00558 417 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FERMT2Q96AC1 680 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FGD4Q96M96 766 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ACAD9Q9H845 621 aa14.46□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 EYSQ5T1H1 3165 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SORBS3O60504 671 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ICAM1P05362 532 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBRQ0VD83 1088 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM51Q9NW97 253 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC69A6NI79 296 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 POTEB2H3BUK9 544 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ADCY6O43306 1168 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 GJA8P48165 433 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF20Q5VTR2 975 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TINF2Q9BSI4 451 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CFBP00751 764 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 BRF1Q92994 677 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.44□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SYCE3A1L190 88 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA4P34932 840 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZUG5 572 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKS1AQ92625 1134 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 DPF3Q92784 378 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXC6P09630 235 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 LHX8Q68G74 356 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 STK3Q13188 491 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMCX2Q7L311 632 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 COL20A1Q9P218 1284 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP2A1O14983 1001 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CYBAP13498 195 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 GRM4Q14833 912 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TCHHQ07283 1943 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGEF1-209ENST00000607882 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms