RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602848.5

PPFIA3-211, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPFIA3, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-211ENST00000602848 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 EDIL3O43854 480 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MTMR2Q13614 643 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 POSTNQ15063 836 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CALCRLQ16602 461 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 RAB34Q9BZG1 259 aa25.2■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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PPFIA3-211ENST00000602848 ICAM1P05362 532 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PDIA5Q14554 519 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PDILTQ8N807 584 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 DHX58Q96C10 678 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MBOAT7Q96N66 472 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CBX8Q9HC52 389 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 VCAM1P19320 739 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 UBA7P41226 1012 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MAP3K9P80192 1104 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.19■■□□□ 1.62
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PPFIA3-211ENST00000602848 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 KIF3CO14782 793 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 OPLAHO14841 1288 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SMC2O95347 1197 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 EPHX2P34913 555 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SREBF1P36956 1147 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PNOCQ13519 176 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 E2F4Q16254 413 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CCDC174Q6PII3 467 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 LDHDQ86WU2 507 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.18■■□□□ 1.62
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PPFIA3-211ENST00000602848 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 A0A087X0B3 334 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 POLR2MP0CAP2 368 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 POTEDQ86YR6 584 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SPATA20Q8TB22 786 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CUEDC2Q9H467 287 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TDP2O95551 362 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CYP3A4P08684 503 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 NF2P35240 595 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SMARCE1Q969G3 411 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 PAGE5Q96GU1 130 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TBX3O15119 743 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SLC26A4O43511 780 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 ZBED4O75132 1171 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 CIITAP33076 1130 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 ARHGAP4P98171 946 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 DISC1Q9NRI5 854 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SLC37A4O43826 429 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MYL1P05976 194 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 GHRHRQ02643 423 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 IQCB1Q15051 598 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 Q4G0T1 1027 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3-211ENST00000602848 FLOT1O75955 427 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 TXKP42681 527 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 SEMA3FQ13275 785 aa25.14■■□□□ 1.61
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PPFIA3-211ENST00000602848 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 CSADQ9Y600 493 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 ZNF536O15090 1300 aa25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 ADM5C9JUS6 153 aa25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3-211ENST00000602848 STAT6P42226 847 aa25.13■■□□□ 1.61
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