RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 TLK2Q86UE8 772 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-209ENST00000591387 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 E7EWF7 191 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 CDK7P50613 346 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 LRCH3Q96II8 777 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 ARVCFO00192 962 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 EDNRBP24530 442 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 PDE4DQ08499 809 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 QRICH1Q2TAL8 776 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 FBXO11Q86XK2 927 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 BADQ92934 168 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TMEM39AQ9NV64 488 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 KLRF2D3W0D1 207 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 RAG1P15918 1043 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 BEX3Q00994 111 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 FAAP100Q0VG06 881 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MTA3Q9BTC8 594 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 AMNQ9BXJ7 453 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SZT2Q5T011 3432 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 LAMA3Q16787 3333 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.955e-7■■□□□ 12.6
CTIF-209ENST00000591387 TRAF1Q13077 416 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 WTAPQ15007 396 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MTMR8Q96EF0 704 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 GRM4Q14833 912 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SCFD2Q8WU76 684 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 ZBTB5O15062 677 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 IWS1Q96ST2 819 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TBX21Q9UL17 535 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.96■□□□□ 0.95
CTIF-209ENST00000591387 TIMP1P01033 207 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 ITGB8P26012 769 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 GHRHRQ02643 423 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TROAPQ12815 778 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TBC1D5Q92609 795 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.95■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 CPT1AP50416 773 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 FPGSQ05932 587 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 ITGA7Q13683 1181 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TTLL4Q14679 1199 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 PPP2R5BQ15173 497 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 SHHQ15465 462 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TMTC2Q8N394 836 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 MAP3K14Q99558 947 aa20.94■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 ANTXR2P58335 489 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 CASC1Q6TDU7 716 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 CHST3Q7LGC8 479 aa20.93■□□□□ 0.94
CTIF-209ENST00000591387 RMDN3Q96TC7 470 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms