RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L18D6R9N7 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L22D6RA61 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L19D6RCP7 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L20D6RJB6 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 OAZ1P54368 228 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PPATQ06203 517 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L24Q0WX57 530 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CALCRLQ16602 461 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CLIC6Q96NY7 704 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO3Q9BYT9 981 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 STK24Q9Y6E0 443 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 ERO1BQ86YB8 467 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM260Q9NX78 707 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-212ENST00000591041 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL11O14625 94 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.694e-11■■■□□ 17.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKG1Q13976 671 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 VGLL4Q14135 290 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 COG2Q14746 738 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 STX1AQ16623 288 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2SQ16763 222 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 LDHDQ86WU2 507 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 IQUBQ8NA54 791 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO10Q9NW15 660 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 UBA7P41226 1012 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 UVSSAQ2YD98 709 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 TKFCQ3LXA3 575 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC26A4O43511 780 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC2O95347 1197 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGCS2P54868 508 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP1BP68106 108 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 TYRO3Q06418 890 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 MEIS2O14770 477 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF76P36508 570 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAP25P60880 206 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CUEDC2Q9H467 287 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CFBP00751 764 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SREBF1P36956 1147 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 PDIA5Q14554 519 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX3O15119 743 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP3A7P24462 503 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 DSG3P32926 999 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP4P98171 946 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 MB21D1Q8N884 522 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CALML4Q96GE6 196 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP3A4P08684 503 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN14P0C7P3 912 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIL2Q13356 520 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 DACH1Q9UI36 760 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 VWA5AO00534 786 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS3O15072 1205 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL1P05976 194 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ALAS1P13196 640 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 STAT6P42226 847 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 SEMA3FQ13275 785 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 Q4G0T1 1027 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM20AQ96MK3 541 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 ELP3Q9H9T3 547 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-212ENST00000591041 POTECB2RU33 542 aa25.54■■□□□ 1.68
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